在人类文明尚未开化的远古时代，近亲通婚非常混乱，不仅旁系血亲，甚至在直系血亲间也可通婚。然而历史资料证明，近亲结婚，新生儿死亡率和畸形率比非近亲结婚高3倍多。所以人们对近亲结婚的危害有所了解，各国也出台了相关法律，直系血亲和三代以内的旁系血亲禁止婚配。
最初文明国家古埃及统治者认为，只有皇室同族通婚才能保持皇室血统的纯洁和高贵，所以当时皇室内部多是亲兄弟姐妹结婚。因为随着人们医疗水平和意识的不断提升，近亲婚配这种现象在埃及已经没有了，而日本这个医疗科技水平发达的国家，竟然还认可古埃及的这种“古老”的思想。现在依然保留坚守着近亲结婚的陋习。
在日本君主制度里，为了保持皇室后代血统的纯正，天皇选择伴侣的时候，不光要挑貌美的女子，其还要知书达理，温婉贤惠，同时必须有皇室的血统。不然的话，不管女子再美貌也是没用的。
最为关键的条件是“皇室血统”，也就是说一个女子再怎么美貌和优秀出挑，如果缺少血统这一关联脉络的关系存在，那她将失去入选天皇“妃子”的名单。虽说日本的君主制的出发点是为了保证皇室血统，可纵观日本的历史，天皇和自己亲戚结婚产下来的孩子不是痴呆儿就是夭折，所繁衍的后代根本没有几个，所以近亲结婚在很多国家是不被提倡的，是符合科学依据的。
