在中國的古代傳説中，女媧也是人類的始祖，是伏羲的妹妹。傳説在遠古的時候，有一天支撐着天穹的四根大柱子突然折斷了，半邊天空坍塌下來，蔚藍色的天幕上露出個黑洞洞的大窟窿；大地也忽然裂開，支離破碎了。天不能完全覆蓋住大地，地也不能完全負載萬物了。洪水在四處氾濫，大火在各處燃燒。女媧看到人們面臨着如此的滅頂之災，心裏非常難過，決心把坍塌下來的半邊天補上，把天下兒女們從水深火熱中拯救出來。於是她來到崑崙山上，親手熔鍊了五色石子，把蒼天修補好，天空又變得和先前一樣美好；她又砍下大烏龜的四隻腳，用來代替天柱，樹立在大地的四方，將天空支撐起來；她還把那興風作浪的黑龍殺死，使得中原的百姓得以安生；然後，她又把蘆葦燒成灰燼，堆積起來，用它阻擋住了滔滔的洪水。經過女媧一番辛苦的勞作，破損的蒼天終於補好了，四極穩住了，洪水也退下去了，惡禽猛獸被誅殺了，中原一帶災難平息了，善良的人民得到拯救，又過上了無憂無慮的生活。
在中國古代傳説中，還流傳着伏羲女媧兄妹通婚的故事。故事中説，伏羲和女媧是兄妹關係，天降洪水，兄妹倆爬進一個大葫蘆裏，躲過了劫難，然後兄妹結婚，繁衍了人類。在唐末李元的《獨異志》中記載最詳：“昔宇宙初開之時，只有媧兄妹二人在崑崙山，咒曰：‘天若遣我兄妹二人為夫妻，而煙悉合，若不，使煙散。’於煙即合。其妹即來就兄。”
在河南唐河出土的漢畫石上，有一幅伏羲女媧圖，其前均有兩朵煙，象徵着夫妻可以結合。還有的漢墓畫像石上的伏羲女媧像，多做交尾狀。將伏羲畫成鱗身，將女媧畫成蛇軀。把他們比喻成人格化的蛇神和女神。有的漢畫石上的伏羲和女媧分別手捧着太陽和月亮，意為伏羲是太陽神，是陽精；女媧是月亮神，是陰精；取義陽光雨露滋育着萬物生長。
如今，在陝西省臨潼驪山有一座人祖廟，廟裏面仍供奉着女媧。這裏每年要舉行兩次祭祀，一次在農曆３月３日，一次在農曆６月１５日。當地的人們又把這兩次廟會稱為“單子會”。很多不育的婦女往往趁廟會之時，夾着牀單，懷裏藏着布娃娃，先到驪山的人祖廟給女媧燒香許願，然後再偷偷地夜宿附近的樹林中。附近各村的青壯年男子，在晚飯後也多上山，遇到這些不育的婦女，便可就地同居。次日清晨，這些婦女回村時，只能低頭走路，不可回顧，否則會“沖喜”。
為什麼在中國遠古時兄妹可以通婚呢？這就要從人類最原始的婚姻狀態説起。人類最初是沒有婚姻和家庭觀念的。最初人類的兩性關係是雜亂的，隨着古人採集、狩獵經濟的發展，古人們在勞動中開始按照男女、年齡進行分工，他們的思維也發生了進步。父母開始不願與自己的子女發生兩性關係，最後人類終於排斥了雜亂的兩性關係，發展成比較固定的血緣羣團，又稱血緣家庭或血緣公社。它既是一個生產生活單位，又是一個內部通婚的集團。在這裏面開始不許祖輩與少輩之間、雙親與子女之間發生兩性關係，而卻允許兄弟姐妹之間互相通婚。這種血緣羣婚在人類發展史上經歷了以百萬年計的漫長歲月，據人類學家考證，在我國發現的雲南元謀人、陝西藍田人均屬於分類學上的直立人階段，他們大致都處於血緣公社時期。
在我國的少數民族中，如納西族、傣族、苗族、侗族、壯族、黎族、高山族等，現在還都流傳着兄妹通婚的神話。此外，在一些少數民族地區，現在還或多或少地保留着血緣婚的殘餘。
伏羲和女媧的年代距今有多長時間，現代的歷史學家還給不出一個準確答案。但是有一點可以認定，他們一定是生活在原始社會的血緣公社時期，而這一時期的時間跨度，要有百萬年以上。馬克思曾説：“在原始時代，姊妹曾經是妻子，而這是合乎道德的。”這樣看來，伏羲和女媧兄妹通婚也就不足為奇了。
