內閣之位最早出現在明代，作為朱元璋廢除宰相後，輔佐皇帝處理國事的機構，一直延續到了清代。在這個過程中，內閣的地位也在不斷地變化，直到軍機處的誕生，開始直接對內閣的輔政功能產生影響，清朝也一直保持着軍機處和內閣共生的現狀。
軍機處可以説是皇帝最親密的直屬機構，直接聽取皇帝的指令形式。其存在的很大意義，就是為了加強皇權，能夠幫皇帝的命令，最直接的執行到位，這裏面大有取代內閣的意味。然而，為什麼軍機處成為中樞機構後，還不能將內閣取代？
在雍正設立了軍機處之前，內閣一直都是清王朝的主要國事處理機構，這個機構從明代開始，一直沿用下來。內閣的設立最早能追溯到洪武年間，設置殿閣大學士以後，入直參與機務的，大多是翰林院出身，這就是內閣的最早組成。
當年朱元璋在殺害胡惟庸時，其目的就是為了廢除沿用千年的宰相制度，使得權力完全集中在皇帝手中，實現真正的中央集權。然而，在失去宰相後，面對大量的國事奏摺，朱元璋一度陷入了困境中。於是他在六部外，設立了一個獨立的四輔官制度，成為幫助皇帝處理國事的秘書機構。
直到明成祖時期，才在四輔官制度的前提上進行升級，也開始有了真正的內閣制度。不過，這個時候的內閣僅僅是作為秘書的職能，其品級不高，不具備真正的實權。直到清兵入關後，在沿用了明朝的內閣，並加以升級，成為真正有實權的機構。
既然有了一個輔佐皇帝的內閣，為何還要設立軍機處？
軍機處最初設立的目的是因為雍正時期，西北戰事頻繁，由於內閣的主要目的就是審閲奏摺，輔佐皇帝執政。面對大量的戰爭情報，雍正當心泄密，於是設立了軍機處，地點在隆宗門，在裏面辦事的都是滿族的親王和大臣。
《清史稿》：“雍正七年，用兵西北，慮泄機密，始設軍機房，後改軍機處。”
不過，當戰爭結束後，雍正深感軍機處的便捷之處，於是將其保留，並改名為“總理事務處”，專門處理皇帝的直屬事務。直到乾隆時期，才在乾隆帝的授意下，將其改名回“軍機處”。
其實，設置軍機處還有另一個作用，因為內閣的權力日益增高，嚴重影響了皇帝的中央集權。乾隆為了能夠更好地控制朝廷，所以將軍機處重新啓用，目的就是為了平衡內閣的權力，甚至有取代的意味。然而，軍機處卻並不能真正地取代內閣，甚至與之形成了共生的關係。
因為，軍機處在設立之初，就是為了解決皇帝之不便。尤其是，一些關鍵時刻，皇帝無法直接找到內閣大臣，並要求他們執行政務。這時候，有一個軍機處能夠直接處理他的指令，是最為高效的存在，所以，軍機處一直存在。
明代當時並沒有軍機處的存在，皇帝想要處理一下加急的事情，只能依靠宦官來執行。這種方式就間接的擴大了宦官的實權，從而出現了宦官亂政的事情發生。清朝為了避免此種情況發生，於是，設立了由滿人組成的軍機處，成為皇帝的心腹。
《清史稿》：“自軍機處創設以來，一切承旨書諭及辦理各件，皆關係機要，此與前代所稱平章軍國重事相相仿，非專指運籌決勝而言。”
其實，軍機處還和內閣一直存在着交集，因為無論軍機處處理皇帝的何種指令，最終的奏摺依然會回到內閣這邊進行審閲。同時，我們仔細翻看清朝歷史，凡大學士往往都兼軍機大臣，即管理內閣又掌軍機處。
可以説，軍機處和內閣就是皇帝處理事情的兩個職能部門，不過兩個部門的處理機密程度不同。不過，組成人員可以相似有重疊。
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【參考文獻：《清史稿》】
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