1939年6月，海軍戰時總司令部正式成立佈雷總隊，下轄5個分隊。11月至1940年初，又將其主要力量建為長江中（下）遊佈雷總隊，下設5箇中隊，11個分隊。將長江中下游宜昌—江陰段劃分為三個佈雷游擊區：第一遊擊區作戰地段在湖口—江陰之間；第二游擊區作戰地段在鄂城至九江之間；第三游擊區作戰地段主要在荊江區域，後因日軍從未能實現其打通荊江、直犯川江的企圖，第三游擊區遂併入第二游擊區。
海軍佈雷隊
佈雷游擊隊居無定所，神出鬼沒，風餐露宿，晝伏夜出，依靠民眾，瞭解敵情，強韌不屈，可泣可歌（佈雷隊偵察員、海軍英雄陳木生偵察時由於漢奸出賣被日寇所俘，堅強不屈，竟被日寇活活鋸死，拋屍江中。臨死，痛罵日寇不絕。其戰友獲悉，均咬牙切齒，同仇敵愾誓為之復仇）。佈雷游擊隊採用了各種靈活機動的佈雷戰術：利用夜幕，迫近佈雷；利用惡劣天氣，出其不意佈雷；長途奔襲，迎敵而上佈雷；伺機出擊，乘虛而入，臨機佈雷等。還專門研製了適用於佈雷游擊戰的小型水雷。（韓真：《軍事歷史研究·海軍長江抗戰述論》，第101、102頁。）在其奮勇作戰下，日軍於長江所佔航線，明佔實丟（失），不僅無法控制，而且損失極其慘重。
被我方水雷炸壞的日軍艦艇
據中國海軍統計，1940年共擊沉擊傷日艦船218艘，其中中型艦15艘，運輸艦22艘，商船3艘，汽艇61艘，駁船8艘被完全擊沉。另擊傷日軍中型艦14艘，小型艇18艘。絕大多數為水雷所毀傷。據英國駐華使館的不完全統計，1940年，侵華日艦被水雷炸沉8艘，炸傷100餘艘。（韓真：《軍事歷史研究·海軍長江抗戰述論》，第103頁。）1941年1月25日，日運輸艦一艘於馬當下遊鐵板洲觸雷沉沒，200餘名官兵斃命。同年10月8日，日運輸艦“山田丸”、“村木丸”又於馬當附近觸雷沉沒，又有200餘名官兵斃命。被打怕的日本海軍長江艦隊司令部於1940年5月22日發佈四條訓令：一、禁止集結航行；二、凡行駛蕪湖以上的商船均須由軍艦護航；三、所有艦船不得於夜間行駛於蕪湖—九江之間；四、凡艦船行駛於蕪湖上游時，須加速通過。（《炎黃春秋》2005年第9期，第34頁。）
武漢長江上的日軍海軍水上飛機
海軍還在鄱陽湖、贛江、甌江、甬江、閩江、西江實施了廣泛佈雷，封鎖日軍。據不完全統計，至抗戰勝利，海軍佈雷遊擊總隊僅在第一遊擊區就佈雷1370具，炸沉炸傷敵艦船114艘。八年抗戰，海軍共擊沉敵艦船186100餘噸，絕大多數為水雷所毀。海軍所用水雷絕大多數為海軍辰溪製造廠等自制，包括九種定雷，三種漂雷。（蔣文瀾：《中國抗日戰爭實錄》，第171頁。）
八年抗戰，中國海軍以海空戰、阻塞戰、要塞戰、水雷戰等多種戰法，在實力極其懸殊的境況下，仍取得輝煌戰績，寫下了八年抗戰中濃墨重彩的一筆。致日本海軍在侵華戰爭中屢遭挫折，戰果最小。時任中國海軍總司令的陳紹寬上將總結道：“海軍抗戰事略，向來極少發表，蓋不欲大事宣傳，事實足以表明一切。”海軍抗戰，“因此適足達成我消耗戰、持久戰之目的，而（最終）完成殲滅戰之任務”。