1942年冬，侵佔南京的日本侵略軍高森部隊，準備在郊外建飛機場時，發現一座熒光閃閃的古墳，日軍立即進行挖掘。
不久就發現一石槨，石槨內藏一石函，石函兩側刻有文字，一面為：“大唐三藏大遍覺法師玄奘頂骨早因黃巢發塔今長幹寺演化大師可政於長安傳得於此葬之”;另一面為“玄奘法師頂骨塔初在天禧寺之東岡明洪武十九年遷於寺之南岡三塔之上”。
為了驗證真假，五名原中央大學考古學專業的教授被日軍“請”來，對石函進行考證，同時為嚴防消息泄露，日軍禁止教授們與外界接觸，還將挖掘的民工殺掉。
那麼，這些舍利子真的是唐僧的嗎?唐僧是在西安去世，為何安葬在南京呢?日軍敢帶走這些舍利嗎?
唐僧，法名玄奘，唐代著名高僧，法相宗創始人，被尊稱為“三藏法師”，俗稱“唐僧”，與鳩摩羅什、真諦並稱為中國佛教三大翻譯家。
玄奘俗名陳禕，於602年出生於洛州緱氏(今河南洛陽偃師)。自幼年跟父親學儒家典籍，父親去世後，隨長捷法師(玄奘二兄)入寺受學《法華經》、《維摩經》等。
唐武德五年(622年)，玄奘在成都受具足戒，之後他遊歷各地，參訪名師，講經説法。但玄奘師深感真諦等古德譯著不完善，致使一些重要的理論問題有很大分歧，難以融合，就產生去印度求真經的意願。
玄奘，於公元627年離開長安，開始西行。往返十七年，行程五萬裏，從印度取回非常豐富的梵筴佛典，共526筴、657部經卷。
回到長安後，玄奘法師受到太宗的熱烈歡迎，還親自為他建寺。
玄奘頂骨舍利供奉在“玄奘大師頂骨塔”裏
之後，他又用二十年的時間從事翻譯工作。
唐高宗麟德六年(664年)，玄奘圓寂。高宗獲悉後，竟五天不上朝，認為大唐痛失國寶。
據文獻記載，玄奘法師圓寂後，葬於西安興教寺塔，唐末黃巢起義時遭盜而捐殘。宋朝時，天禧寺和尚法政，在陝西終南山紫閣寺發現玄奘法師頂骨，迎請到南京天禧寺供奉。明太祖時，天禧寺更名為長幹寺，玄奘頂骨舍利移至南崗，修三藏塔安置。至朱棣時，在長幹寺原址上修建大報恩寺，於玄奘三藏塔前建三藏殿。清未遭太平軍燹而毀。
1943年2月3日的《國民日報》率先披露日軍盜挖唐僧舍利後，引起中國民眾強烈不滿，紛紛發出要求歸還的呼聲，要求汪精衞偽政府出面干預此事。
日軍迫於輿論壓力，23日出版由谷田閲次署名的《三藏塔遺址之發掘報告》，承認玄奘法師頂骨出土的事實。
之後，由偽外交部長兼文物保管委員會委員長褚民誼接受日軍歸還的文物，但日方私自留下其中一份。
玄奘法師頂骨舍利重見天日之後，幾經曲折，終於回到國人手中。
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