關於現代智人的起源，如今最廣為人知的是“非洲起源説”。上世紀80年代，西方學者採用DNA技術，研究發現非洲誕生出現代人類，然後從非洲走向世界各地。早期認為，非洲智人徹底取代了各地的早期智人或直立人，這就是“完全取代假説”；後來認為，遷徙到世界各地的非洲智人，吸取了當地人的少量基因，這就是“同化假説”。
與“非洲起源説”大約同時存在的，還有一種“多地區起源説”，即人類是在多個地區起源的。之所以會出現“多地區起源説”，原因在於DNA技術存在很大的侷限性，並不能100%肯定人類起源於非洲，同時很多考古遺存也與“非洲起源説”相悖。
除此之外，前些年中國學者黃石，提出了DNA技術新理論，通過一系列基因研究，提出了“人類東亞起源説”，徹底顛覆了“非洲起源説”。
那麼，從現在發現的信息來看，中國人到底是獨立起源，還是起源於非洲？事實上，雖然主流基因研究不太支持，但考古證據卻表明“中國獨立起源”。
1983年，科學家們根據線粒體DNA系統發育樹，構建了首個現代人起源的分子模型，認為現代人起源於亞洲。
1987年，西方學者採用DNA技術，比較了全世界各地女性的線粒體DNA，發現非洲裔女性的線粒體DNA多樣性最高，於是在此基礎上提出了“非洲起源説”，指出現代人有一個5萬年前的共同祖母，即“夏娃假説”。2000年左右，遺傳學家又採用Y染色體從父系視角進行追溯，提出“亞當假説”。中國學者金力的分子遺傳學研究，也支持“人類起源於非洲説”。
中國科學院昆明動物研究所研究員宿兵：“幾乎所有過去20多年遺傳學研究的證據都支持現代人非洲起源的假説。DNA的特點是代代相傳，沒有間隔或斷裂；並且，DNA複製的錯誤率，即基因突變的速率是基本恆定的，這是利用分子鐘進行年代推斷的根據。”
當然，通過對比歐洲現代人與尼安德特人的基因，研究發現現代人身上還保留着20%的尼安德特人基因，因此人類起源於非洲的“完全取代假説”被推翻。因此，後來的非洲起源説，認為非洲智人是現代人基因的主要來源。
然而，現在DNA技術手段，是依據活人的DNA變異程度，往上推測出羣體的歷史。遺傳學者認為非洲人基因更為豐富，意味着變異多、傳承的代數多，因此存在時間更長。但這種研究方法的前提之一是“基因突變的速率是恆定的”。
古人類學家、中科院院士、“多地進化學説”權威吳新智，認為用突變率計算人類起源時間這套方法值得商榷：“就好比生活於4.5萬年前的古西伯利亞人，檢測其正染色體、Y染色體、線粒體得出的突變速率是不一樣的。所以，假定速率恆定有一定問題。2000年，人們又發現了600萬年前的人類化石，這個突變速率又要改。”
前些年，中南大學教授黃石提出“遺傳多樣性上限理論”，通過一系列基因研究發現了“現代人Y染色體和線粒體出自東亞的分子證據”，於是黃石宣稱“現代人類（現代智人）起源於湖南已獲人類分子學支持”。
都是頂尖學者，都是通過基因技術，但不同方法、不同理論，得出的結論卻不同。何況，還存在採集的樣本廣泛性問題，古人類樣本是否有效，研究的鹼基對過少（人類有30億鹼基對，上世紀末時只研究300對）等問題。因此，至少從目前來看，基因技術溯源人類的起源，似乎還存在着很多不確定性，其中主要建立在基因技術上的“非洲起源説”，儘管如今也似乎更具説服力，但還是一種假説，並不是真相。
對於人類起源的探索，除了基因研究之外，還有化石、文化等的研究，而化石、文化研究的結論，並不支持“非洲起源説”的“完全取代假説”或“同化假説”，反而更支持獨立起源。
上世紀30年代，德國學者魏登瑞研究北京人化石，以及黃種人數十項特徵之後，得出了“中國人是從中國猿人到現代人連續進化”的結論。
過去的研究中，學者還發現距今170萬年的元謀人、距今20到70萬年的北京人等等古人類，幾乎無一例外的都有“鏟形門齒”，而今天大約有80%—90%的現代中國人有“鏟形門齒”，黑人只佔11.6%，白種人只佔8.4%！
也就是説，“鏟形門齒”是中國人的關鍵特徵之一，傳承到現代至少已有170萬年，在非洲、歐美卻非常少見，這是“中國獨立起源”的有力證據之一。
從石器文化上看，“非洲起源説”也有一個難以解釋的現象。按照“非洲起源的同化假説”，大約6萬年前非洲晚期智人來到東亞，大部分取代了當地原住民。根據非洲考古顯示，當時非洲智人的石器主要屬於“第三模式”。然而考古顯示，中國很長一段時間內使用的是“第一模式”，比“第三模式”要落後一些。如果是“非洲起源的同化假説”，那麼為何當時中國智人還會摒棄先進的“第三模式”，而繼續使用落後的“第一模式”？
2007年，在廣西崇左的智人洞，專家發現了一塊下頜骨，距今超過10萬年，下頜骨上有着“萌芽狀態的頦隆突”。“頦隆突”是現代人的特徵之一，“萌芽狀態的頦隆突”是一個進化過渡形態。早前，在非洲發現類似的一塊有着“萌芽狀態的頦隆突”的下頜骨，一度被認為“非洲起源説”的關鍵證據之一。但在中國有着同樣的發現，説明非洲存在的向現代人的進化過程，在中國也存在過。
通過對中國發現的化石、人體類型、經濟活動等研究，發現幾十萬年前的直立人，到現代人之間，形態上有着相似性，同時中國境內發現的2000多處的石器，總體上是一脈相承，沒有外來文化的痕跡，據此一些學者判斷認為“中國境內發現化石的古人類是中國人的祖先”。
總之，從基因研究上來説，更傾向於現代中國人起源於非洲，但單從“鏟形門齒”、石器文化、廣西智人洞下頜骨上看，現代中國人不可能源自非洲，而是本土獨立起源的。當然，中國出土的遺骨上存在外來痕跡，説明的確吸收了一些外來基因，但現代中國人主要還是居住在中國的族羣連續進化的結果。
參考資料：《基因能否證明我們的祖先都來自非洲》等