為了犒賞擁立自己的有功之臣，朱祁鎮不僅嚴懲了當年擁立自己弟弟朱祁鈺登基的于謙等人，還把內閣首輔陳循也罷官流放。
在陳循被罷免首輔之職後，高榖在內閣中負責處理政務。不過，他既沒有太大能力，也不是擁立朱祁鎮復位的功臣，自然只能是一個過度的角色而已。
一個多月後，明英宗正式任命徐有貞為第九位內閣首輔。不過，這位首輔是自設立此職以來最差的一位，無論從德行還是能力上，徐有貞都明顯遜色於之前的幾位首輔。
徐有貞（1407年——1472年），字元玉，號天全，晚年又號天全翁，南直隸吳縣人。作為明朝的首輔，他最著名的不在政治方面，卻在雜學方面，比如天文、地理、歷史、灌溉、書法、星象、陰陽、方術等都非常的出名。
明朝歷來就有“非進士不入翰林，非翰林不入內閣”的傳統，自然，徐有貞也不能例外。他在中進士後，開始在編修的崗位上苦熬資歷，不過一直沒有取得進階之法。
1449年，由於太監王振的慫恿，明英宗朱祁鎮在一意孤行之下御駕親征，遭遇了明朝歷史上最慘痛的“土木堡之變”。英宗皇帝不僅自身被俘，還連帶數十萬明軍士兵和數十位朝中重臣一同殉國。據《明史英宗前紀》記載:
辛酉次土木被圍壬戌師潰死者數十萬。
消息傳回到京師，朝野譁然。為了穩定朝局，于謙在太后的支持下擁立朱祁鈺登基稱帝，史稱明代宗。
當時，面對是戰是逃的問題，滿朝大臣分歧甚大，除了于謙等人堅決誓守北京城外，以徐有貞為首的一幫朝臣卻鼓吹南遷回南京。
徐有貞根據自己的所謂星象天學，極力主張躲避蒙古人的鋒芒，儘快遷都南移。結果，他的這套歪理學説因為太過荒誕不稽，遭到了滿朝文武的嘲笑。
在於謙等主戰派的超常發揮下，明朝取得了北京保衞戰的勝利，不僅趕跑了蒙古的瓦剌部大軍，鞏固了朱祁鈺的政治地位，還捍衞了大明的江山社稷。
瓦剌的首領也先儘管遭到了軍事失敗，撤軍返回蒙古，但並沒有消除對於明朝的敵意。他眼見明朝新帝已經登基，自己手中的籌碼朱祁鎮已經沒有多少剩餘價值可以榨取，索性將其釋放回京，成心為難明廷。
隨着朱祁鎮的釋放，明廷確實顯得左右為難。代宗皇帝朱祁鈺已經坐穩皇位，但英宗皇帝卻被放了回來，咋辦？畢竟皇位具有明顯的唯一性。在首輔陳循和于謙等人的商議下，朱祁鈺繼續當皇帝，被釋放回家的朱祁鎮擔任太上皇。
之後，徐有貞的仕途之路越走越窄，因為他依據星象學而建議南遷的主張，儼然成為了當時的笑談。
不過，功利心極重的徐有貞並沒有放棄希望，他決心投靠陳循和于謙，贏得他們的支持。可惜，明代宗朱祁鈺卻牢牢記住了這位“星象大師”，堅決不同意晉升。
1457年，明代宗朱祁鈺病重，在朝中久不得志的石亨等人，暗中聯絡太監曹吉祥，欲迎明英宗朱祁鎮復辟稱帝。可是，這些武將和太監都不善於出謀劃策，就拉攏徐有貞這位文臣加入他們的政變隊伍。
徐有貞一看有機可乘，壓抑多年的怨氣終於有機會抒發，就欣然接受參與政變。在他的具體籌劃之下，這些人入宮擁立朱祁鎮成功復辟，史稱“奪門之變”。
明英宗復辟後，徐有貞因為擁立之功而得到重用，被授予翰林院大學士並取代于謙出任了兵部尚書，兼華蓋殿大學士，掌文淵閣事，成了大明的第九位內閣首輔。
明代宗時期，徐有貞一直感覺自己屈居於謙等人之下，非常的鬱悶。今天，自己已經成為內閣首輔，他認為秋後算賬的時機已然成熟。
明英宗雖然對於謙等人當年擁立自己的弟弟朱祁鈺登基耿耿於懷，但他深知，若沒有北京保衞戰的勝利，明朝勢必難逃北宋王朝一樣的命運。于謙雖然被下獄，但朱祁鎮並不打算處斬他，只准備罷官歸鄉。
不過，在徐有貞的暗中聯絡下，羣臣開始上奏彈劾于謙等主戰派。而作為首輔，徐有貞也不斷推波助瀾，聲稱“不殺于謙，復辟無名”，迫使朱祁鎮下旨處死於謙。
收拾掉于謙後，徐有貞還不消停，將曾經有恩於自己的前任內閣首輔陳循也發配流放。
哲學上講，矛盾無處不在。這句話，特別適用於徐有貞，在處理了主要矛盾于謙、陳循等人外，徐有貞將目標對準了自己的聯盟內部，對準了與他一同參與“奪門之變”的石亨和曹吉祥。
結果，這次徐有貞失算了。在石亨和曹吉祥的聯合下，明英宗將擔任首輔僅僅半年的徐有貞貶為庶民，流放到金齒（今雲南）。看來，面對他無休無止的傾軋和攻訐，朱祁鎮已經厭煩了。畢竟，任用首輔是為了解決問題的，而不是為了製造事端。
不過，比起石亨和曹吉祥來，徐有貞還算幸運的。天順四年，明英宗下旨處死石亨，並且沒收其全部家產。天順五年，明英宗又下旨將曹吉祥處以磔刑。
原來，明英宗越來越覺得自己當初錯殺于謙、流放陳循是多麼的愚蠢。而造成這些的，無疑就是石亨、曹吉祥等人。
或許，徐有貞應該好好感謝石亨和曹吉祥，若他此刻還賴在首輔的位子上，必然也會遭到朱祁鎮的清算。
在明憲宗即位後，雖然赦免了徐有貞，但卻再沒有起用他，一直都賦閒在家。眼見覆出無望的徐有貞，在回鄉後整日縱情山水和筆墨之間，多次到宜興等地遊覽，並題詞作畫。
徐有貞的人品雖有污點，但書法卻堪稱一絕，尤其擅長行書和草書，頗有宋朝米芾的神韻。他留傳後世的作品有《別後帖》書札等佳作，今收藏於北京故宮博物院內。徐有貞無子，他的弟子吳寬和外孫祝允明均受其薰陶，成為了“吳門書派”的中堅力量，取得不俗的藝術成就。
明成化年間，徐有貞在家中過世，享年六十六歲。