《火影忍者》中有兩個使用瞳術的家族，一個是白眼為主的日向家族，另一個是血輪眼為名的宇智波家族。為避免白眼的能力被其他村莊奪去，日向一族會使用籠中鳥這種咒印來控制，而宇智波沒有這種咒印，所以他們的眼睛被外人覬覦和忌憚，於是在某天被滅族了，下手的還是本族的宇智波鼬。
宇智波鼬從小就表現出非凡的實力，所思所想也和同齡人不一樣，在十三歲時，聯合帶土對全族進行屠殺。外界都説宇智波高手盡出，族中大了宇智波鼬很多歲的長輩，怎麼被輕易放倒？宇智波富嶽和宇智波美琴早已聽見聲響，為什麼不進行阻止？
當初千手柱間聯手宇智波斑創立了木葉隱村，隨着時光流逝，千手一族人丁稀落，宇智波家族成為了木葉最強的一族，在千手扉間擔任二代火影期間，成立了木葉警務部隊，負責這個部隊的便是宇智波一族，族長宇智波富嶽擔任了隊長一職。
因九尾事件，宇智波受到木葉高層懷疑和排擠，也因為他們沒有參與九尾事件，被全村村民誤解，所以被安排到邊緣地區被各大家族監視，宇智波一族不滿這種安排，企圖發動政變奪得木葉統治權。強壓之下，宇智波富嶽安排宇智波鼬作為眼線獲取情報，這讓年少的鼬起了抵抗的心理，父子的關係逐漸冷淡。
隨着村子和家族矛盾加深，加上宇智波止水被團藏奪取血輪眼，政變已經不可阻止，而夾在木葉和宇智波之間的宇智波鼬成了關鍵，為了長遠考慮，宇智波鼬選擇了木葉，邀請帶土開展了誅滅宇智波的計劃。
宇智波一族高手雖多，開啓萬花筒寫輪眼的只有富嶽和鼬兩人，加上各國對血繼限界的爭奪，很多宇智波族人消失，木葉警備部隊早已經名存實亡了，在帶土的神威和宇智波鼬的暗殺技巧下，高手抵抗的機會也沒有。
宇智波富嶽也曾與鼬對峙過，直到他告知了自己的全盤計劃，才明白鼬的所作所為是為了保護木葉，宇智波富嶽面對政變失敗，坦然接受，為了避免親人自相殘殺，甘願死在他的刀下，於是宇智波鼬留下年幼的佐助，揹負了叛忍的罪名，逃離了木葉。
宇智波滅族既有木葉高層偏見的原因，也有族人不甘現狀的反抗意識，兩方相壓下，富嶽一家才是最難的，窮途末路之時，只能以死作結，富嶽認可鼬的做法，才保留了宇智波的火苗傳承下去。