豆腐應當是中國家庭餐桌上最常見的食材之一了，不僅可以製作成各種美食，比如鯽魚豆腐湯、麻婆豆腐等等。但是豆製品營養豐富，水分含量高，儲藏不當極易滋生細菌，導致變質。
豆腐不能與含草酸高的食物一起吃，其原因是豆腐含鈣高，鈣與草酸可生成難溶或不容的草酸鈣，影響鈣的吸收。如菠菜、竹筍、莧菜等含草酸高，但是如果將烹飪方法改變一下，還是可以的。如將菠菜、竹筍等含草酸高的食物先用開水過一下，就可除去大部分的草酸，就可以減少其影響。
痛風病人和血尿酸濃度增高的患者應慎食豆腐，因為豆腐含有大量嘌呤。平時胃寒的人，如食用豆腐後有胸悶、反胃的不良反應，應停止服用。平時易腹瀉、腹脹脾虛的人，也不宜多食豆腐。
部分地區有食用自制發酵豆製品的習慣，比如自制腐乳、豆豉、納豆等。這些食物水分含量較高，易受雜菌污染，如果操作不當被肉毒桿菌污染了，可能會引起中毒。建議消費者儘量少買自制發酵豆製品。
鮮豆腐含有大量的類黃酮、卵磷脂，這些成分都不會因冷凍而減少。補充類黃酮和卵磷脂等有助於預防老年痴呆症，預防骨質疏鬆、乳腺癌和前列腺癌的發生，是更年期婦女的首選食品。