新京報訊(記者 周懷宗)近日,記者從中國農業科學院獲悉,一種研究土壤微生物羣落的新策略被提出,這一策略由該院農業資源與農業區劃研究所植物營養團隊提出,相關成果發表在《土壤生物學與生物化學(Soil Biology & Biochemistry)》上。
相對定量(RMP)和絕對定量(AMP)方法對微生物羣落結構分析的差異。中國農科院供圖
微生物羣落的組成和功能在人類健康、全球元素循環、作物生長和植物抗病中發揮關鍵作用。隨着高通量測序等技術的革命性突破,極大地增加了我們對微生物多樣性、羣落結構和物種組成的認識。
不過,研究人員介紹,測序數據僅提供微生物羣落的相對丰度變化,忽略了微生物絕對數量的變化規律。針對高通量測序數據的這一缺陷,研究人員已經開發出多種微生物絕對丰度定量方法,例如,內參法、熒光定量法與高通量測序結合、流式細胞儀與高通量測序結合等。然而,這些定量方法的普遍適用性和精確度尚不清楚。
在此次研究中,團隊利用採自黑龍江海倫和海南三亞的兩類差異較大的土壤樣品,評估了土壤微生物研究中最常用的兩種絕對定量方法內參法和熒光定量法與高通量測序結合的方法。結果表明:內參法在準確性、穩定性和工作量等方面沒有顯示出任何優勢。相比之下,更常用的熒光定量法與高通量測序結合的方法對探究環境擾動對土壤微生物動力學的影響提供了有價值的見解。考慮其穩定性和技術可行性,熒光定量法與高通量測序結合方法可廣泛應用於土壤微生物羣落的定量研究。
新京報記者 周懷宗
編輯 張樹婧 校對 趙琳