劉昌俊説，目前， 我國研究生招生結構中博士生招生佔比小、碩士生招生數過多，已經很不適應當前國內經濟社會發展， 也不能滿足學科建設、基礎研究的需求。尤其在一些亟需突破的關鍵學科領域，博生不足已經成為重要的制約因素之一。而發達國家的高水平院校主要以博士研究生為主。改變我國研究生招生結構、提高博士生佔比刻不容緩。同時，目前碩士生培養存在以下問題： 培養年限短，很難深入融入科研工作；為達到畢業要求，一些碩士生只能開展易於出成果的研究；很多學生在研究生階段才開始接受實驗技能的培訓，客觀造成碩士生開展實質研究的時間少。
因此，他建議教育部、中科院等有關部門進一步總結我國恢復研究生培養以來取得的優異成績，特別是在博士生培養方面取得的突出成績，加大宣傳，讓全社會充分認識我國很多學科在研究生特別是博士研究生培養水平上已經達到國際一流水平；建議教育部、財政部等相關部門儘快協商，重新定位研究生培養目標與方式，調整我國碩士生、博士生招生比例，儘快提高博士生佔比，從根本上優化研究生招生結構；建議國家相關部門，不以招收碩士研究生作為解決本科生就業的渠道或方式。
劉昌俊説，目前，極個別高校已經採用碩士生名額換博士生名額的方式多招博士生，保證了科研創新水平的快速提升。他建議對雙一流建設高校的博士點，在研究生招生結構尚未改變的情況下，實施類似的碩士生名額換博士生名額的方式，保證這些院校對博士生的需要。同時還應進一步加強對我國博士研究生培養質量的監管，保證培養質量。
劉昌俊，天津大學化工學院教授，英國皇家化學會會士，曾任國家自然科學基金委員會化學科學部第九、十、十二、十三屆學科評審組成員。