在清朝有這樣一個非常出名的機構，它規定非該機構成員嚴禁擅入，一旦有人違反規定擅自闖入，即使是皇親貴戚也會被斬首以儆效尤。
這個嚴密的組織就是著名的軍機處。在清末的時候，流傳着這樣一個故事：
湖廣總督張之洞應慶親王奕劻之邀，商議官制改革的相關事宜。可是，當張之洞舟車勞頓來到軍機處的台階之下，卻任誰勸説都不肯向前多邁一步。當時的官員們百思不得其解，多番詢問之後，張之洞才自己透露原因。原來，雍正曾經規定：非軍機處人員進入軍機處當斬。
而當時的張之洞還不是軍機處官員，所以，才立於門前，不敢擅入。
這個故事的真實性已經無從考據，人為杜纂的可能性較高，但是，從這個口口相傳的故事可以看出：
第一：軍機處是由皇帝直接控制的國家政治權利中樞機構，管理極其嚴格莊嚴肅穆。
第二：雍正雖然已經嚴令禁止外人進入軍機處，也制定了極其冷酷的刑罰，可是，被委任為軍機處領班軍機王大臣的慶親王竟然直接叫一個非內部機構人員進入如此重要的權利中心，因此，也可以得出結論：清朝末期軍機處已經嚴重腐化衰敗了。
清朝入關之後，議政王大臣會議權力仍然非常大。同時在內閣大臣中，南方與北方士大夫的黨派之爭仍然延續，黨爭與滿洲貴族內部矛盾糾纏在一起。為了加強皇權，康熙帝於康熙十六年設立南書房，康熙帝在翰林等官員中，“擇詞臣才品兼優者”入值，稱“南書房行走”。
由於南書房“非崇班貴檁、上所親信者不得入”，所以，它完全是由皇帝嚴密控制的一個核心機要機構。
之後，軍機處正式設立於清朝雍正七年，又被稱為“軍機房”、“總理處”，設立的原因是因為雍正統治時期為了防止西北軍情泄露貽誤軍情。而當時的內閣設立在太和門外，極易被有心人鑽了空子，因此，雍正在隆宗門內設立軍機房，選取內閣中忠心耿耿又謹小慎微的大臣來軍機處當值。
設立了軍機處之後，機密的保護性更強了，皇帝召見大臣商議政事也更方便了。但是，軍機處最初建立之時，房屋條件極其簡陋，在軍機處當值也不是一件肥差。雍正時期，軍機房只是幾間草草搭建的板房，到了乾隆時期，條件有所改善，但是，也只不過是把板房修繕成瓦房而已。
並且，建造的非但不富麗堂皇，反而還相當矮小逼仄，冬天裏面滴水成冰，夏天能熱的人汗流浹背難以忍受。據曾在軍機處任職的大學者趙翼後來所著書籍中記載：如此重要的軍權機構辦公地點居然只是五間不起眼的瓦房，軍機大臣跟隨皇上外出需要臨時起草文書時，往往直接趴在地上起草文件。
可是，到了1780年，乾隆五下江南來到江蘇宿遷附近時，當時已經退休告老還鄉的趙翼去恭迎皇駕，卻發現隨行的軍機大臣生活條件蹭蹭的攀升了不止一個等級啊。而軍機大臣也隱隱露出洋洋得意自命不凡的神態，而此時，我們的大學者看到這番景象只能心酸嘆息：
富貴噬人骨，自身生活品質太高了，整天安逸度日，哪裏有時間和精力去關心百姓和國家大事呢？
身為國家最機密的機構，而雍正和乾隆又是出了名的小心眼，提防那些親王國戚的心一個比一個重，自然，軍機處這樣處理國家機密要政的地方是絕對不會讓自己的兄弟參一腳的。所以，強勢的雍正和乾隆在其統治期間，軍機處的成員從沒有親王之類。
然而，這個慣例被嘉慶皇帝打破了。
之前，軍機處唯一的一次尾大不掉，是在和珅擔任領班時期。和珅掌權後，身兼軍機大臣和御前大臣，打破了制衡的框架，要求“凡有奏摺令具副本關會軍機處”。如此以來，在制度設計上，就令軍機處的地位大大提高，不僅參與決策，還實際掌控了信息渠道，所以，皇帝被操縱的風險大大增加。
嘉慶之初，太上皇乾隆皇帝駕崩，嘉慶一上台就先後剷除和珅、福康安這兩大先帝寵臣，之後，連帶拔除了這兩大勢力的許多黨羽，並且，還立即廢除“凡有奏摺令具副本關會軍機處”此條，最終，也造成了朝中無人可用的結果。不得已之下，嘉慶帝只好讓成親王進軍機處擔任職位。
雖然，不久就因政權穩固找藉口罷免了其職位，但是，還是開了先河。
當然，這也為後來恭親王、醇親王和慶親王在軍機處擔任要職架空皇室埋下了隱患。也造就了皇室剛愎自用，任人唯親的情況。由於在軍機處待遇越來越好，當差的利益越來越大，軍機處的職位發展到後來幾乎與世襲無異。之前，軍機處從不收大臣子弟，但是，發展到後來直接想辦法“保送”任職。
軍機處有一方銀印，其重要性僅僅低於皇帝手裏的傳國玉璽。
軍機處設立之初，軍機處擬好文本過皇上目之後會經過重重繁瑣的程序請出這方銀印，用完立馬放回原處，不得有絲毫閃失。可是，後來由於政務既多且雜，一天請幾次印耽誤功夫，於是，軍機處官員就“蓋空章”，提前在許多白紙上蓋印。
然而，這些蓋了印的白紙沒有專人管理，隱患極大。
除了以上種種弊端，軍機大臣之間互相傾軋，明爭暗鬥現象嚴重。在清朝末期外憂內患的國際環境中，於宣統三年，軍機處終於被撤銷，建立新內閣，自此，實行了180餘年的軍機處被廢除。可是，還是沿用以往的軍機處官員框架，其實，這也算是換湯不換藥。
參考資料：
『《嘯亭雜錄》卷2《議政大臣》、《變更行政制度》 、《清廷政局的變化》』