明英宗朱祁鎮被明代宗朱祁鈺囚禁於南宮之時，石亨、曹吉祥、徐有貞等人發動了奪門之變，重新擁立朱祁鎮為帝。重登帝位的朱祁鎮對朝中不支持他的部分羣臣進行了清算，于謙、王文、陳循、商輅等人或被殺或被貶。奪門派的功臣填補了這些政治權力空缺，其中徐有貞入閣，加兵部尚書，石亨被封為忠國公，曹吉祥協理京營，並封嗣子曹欽被升為都督同知。那些攀附奪門派功臣的人都得到不同程度的升遷，其人數竟達數千人。一時間，以石亨、曹吉祥、徐有貞為首的奪門派功臣風光無限。擁有權勢之下，石亨、曹吉祥、徐有貞等人飛揚跋扈，任意把控朝政，此舉引起朱祁鎮的警惕。
年已三十的朱祁鎮，曾經經歷了十四年的皇帝生涯、一年北狩蒙古和七年多的囚禁生涯，早就不是當初那個不懂世事的小皇帝。朱祁鎮很快就發現石亨、曹吉祥、徐有貞等人存在很大的問題：1.他們都只是投機分子，才能有限，實在無法擔當重任；2.他們權勢太大，反而會做出很多違法犯紀之事，例如打擊異己、提拔親信等。
朱祁鎮深為苦惱，雖有心剷除他們，但朱祁鎮同樣會面臨兩個問題：1.這些人都是奪門功臣，剷除他們會落下兔死狗烹的罵名；2.這些人權勢太大，剷除他們會導致朝局動盪。這兩個問題不能解決，朱祁鎮也不敢貿然動手。朱祁鎮只能徐徐圖之，幸好朱祁鎮也不是吃素的，他一步一步地將瓦解石亨、曹吉祥、徐有貞等人的陣營，最終把他們一一剷除。
一、欲使人滅亡，必先使人瘋狂
朱祁鎮被幽禁七年多，對朝局並不瞭解，復位後就非常倚重石亨、曹吉祥、徐有貞等人，對他們言聽計從。只要是石亨、曹吉祥、徐有貞等人提出的建議，朱祁鎮無不一一應允，這就助長了石亨、曹吉祥、徐有貞等人的囂張氣焰。以石亨為例，石亨四處收受賄賂，公然買賣官位，甚至將朝廷中的文職撤換成武將擔任，還要求朝廷給他的祖墓立碑。
御史楊宣、張鵬等人看不下去，於是當面彈劾石亨、曹吉祥，羅列兩人憑恃寵幸獨斷專權的罪狀。朱祁鎮雖然誇獎楊宣、張鵬，卻聽從石亨、曹吉祥的話，將楊宣、張鵬治罪。
其實朱祁鎮並非真的在袒護石亨、曹吉祥，只是心中有所顧忌，認為處置石亨、曹吉祥的時機並未成熟，只能稍微忍耐。在朱祁鎮的故意縱容之下，石亨、曹吉祥等人更是無法無天。當他們氣焰囂張之時，就會受到他人的嫉恨，結怨較多，同時也會犯了種種罪行，落下把柄。日後朱祁鎮對付石亨、曹吉祥時，也不會擔負殺功臣的罵名。
二、從內部突破，明朝的文人與武將、太監本是宿敵，難以共存
石亨、曹吉祥、徐有貞雖然都是奪門功臣，但明朝的文臣和武將、太監向來都不會同心同德。徐有貞任內閣首輔後就開始疏遠石亨和曹吉祥，多次在朱祁鎮面前説石亨、曹吉祥的壞事。
正巧楊宣彈劾石亨、曹吉祥，徐有貞多在背後支持，朱祁鎮卻自忖時機未到，未治石亨、曹吉祥的罪，反而把徐有貞下了監獄，後來又設計讓朱祁鎮把徐有貞貶為庶民。
朱祁鎮對文臣一向都極為防範，反而更親近太監和武將。再加上當時石亨、曹吉祥還掌握兵權，所以石亨、曹吉祥與徐有貞的爭鬥中，朱祁鎮傾向於石亨、曹吉祥，徐有貞僅當了三個月的內閣首輔。
有貞既得志，則思自異於曹、石。窺帝於二人不能無厭色，乃稍稍裁之，且微言其貪橫狀，帝亦為之動。
三、拉攏重要人物，重振皇帝特務機構
朱祁鈺曾打擊錦衣衞，並將錦衣衞劃歸朝廷指揮。與朱祁鈺不同，朱祁鎮非常重視錦衣衞，因為他明白錦衣衞是皇帝專用的特務機構。所以復辟之後，朱祁鎮將錦衣衞奪了回來。不過，錦衣衞指揮使逯杲卻是經石亨、曹吉祥舉薦才上任的，很明顯他是石亨的人。
由於朱祁鎮對錦衣衞的重視，逯杲的地位也水漲船高。對逯杲來講，能夠得到皇帝的信任，自然要比為石亨、曹吉祥效力要好得多。逯杲本就是個唯利是圖的小人，一旦感覺到朱祁鎮對石亨、曹吉祥不滿，逯杲自然偏向於朱祁鎮，為朱祁鎮賣力。石亨、曹吉祥、徐有貞等人的不法之事，很多都是被逯杲偵察得到消息後，上報給朱祁鎮的。
石亨恃寵不法，帝漸惡之，杲即伺其陰事。亨從子彪有罪下獄，命杲赴大同械其黨都指揮朱諒等七十六人。杲因發彪弟慶他罪，連及者皆坐，杲進指揮同知。明年復奏亨怨望，懷不軌，亨下獄死。
四、先把兵權抓在手
在政治鬥爭中，掌握軍權至關重要。明朝自建立以來，軍權一向掌握在五軍都督府手中。土木堡之役，明軍戰敗，于謙挺身而出。為擊敗進犯的蒙古軍，于謙對明朝五軍制和三大京營做了改制，建立團營。明朝擊敗蒙古後，軍權卻仍然掌握在兵部尚書于謙手中，五軍都督府的權力名存實亡。天順年間，朱祁鎮廢除團營，恢復三大京營，但兵部的權力越來越大，軍隊均由兵部調動，那麼兵部尚書之職就很重要了。
天順元年，兵部尚書由陳汝言擔任。陳汝言是曹吉祥、石亨舉薦才當上兵部尚書的，石亨借陳汝言之手插手兵部事宜。陳汝言卻是個貪官，當兵部尚書不滿一年，就被查出貪污。朱祁鎮撤掉陳汝言時，曾當面痛斥石亨，石亨無言以對。朱祁鎮這麼做的目的就是告訴石亨：陳汝言是你舉薦的，出了事你要擔責任，以後你不能再舉薦人才。
結果，朱祁鎮撤掉陳汝言，繼任兵部尚書的是馬昂。馬昂也是將軍出身，頗有軍功。最重要的是，他和石亨等人並不是一夥的，石亨再也不能插手兵部相關事宜。
上顧石亨曰：于謙兵部數年，自賜賚外，無長物。汝言未久，乃爾可恨也？！因柱斧戮地，稱好於謙者三。亨俛首流汗，不能對。
五、先對付石亨，再逼反曹吉祥
當時機成熟之時，朱祁鎮開始一步一步限制石亨的權力。朱祁鎮聽從李賢的意見，裁掉以往石亨和曹吉祥冒“奪門”功而舉薦封官的人，人數竟達4000多人，一舉把石亨和曹吉祥在朝中安插的親信一網打盡。
天順三年（公元1459年）八月，朱祁鎮調時任大同總兵的石彪（石亨的侄子）離開大同，石彪私下授意大同官員出面上奏保留他在大同。朱祁鎮覺得有異，讓錦衣衞指揮使逯杲調查此事。如果石彪只是私下叫人奏保，朱祁鎮又何必大動干戈呢？朱祁鎮顯然是想對付石亨，而且掌握了一定的證據，以石彪為突破口。
逯杲也算是盡職盡責，竟查出石彪私下藏有龍袍等違法物件，進而牽扯出石亨石彪謀反之事，朱祁鎮果斷抓捕石彪，並剝奪石亨的一切權力，後來石亨死在獄中。
曹吉祥和石亨本來就穿同一條褲子，石亨一倒，曹吉祥哪還能坐得住？天順五年(1461年)七月，曹吉祥與乾兒子曹欽商定起兵謀反。事發當晚，此事被左軍都督府事吳瑾事先得到消息，並向朱祁鎮告發昭武伯曹欽叛亂之事，懷寧侯孫鏜召甘涼西征軍和禁軍共抗叛軍，最終兵部尚書馬昂及時率軍趕到，平定叛亂，將曹吉祥一家全部滅族。
朱祁鎮平定曹、石之亂，表現了朱祁鎮在政治上的老道。剛復辟時，朱祁鎮對石亨、曹吉祥、徐有貞等人多有倚重之處，需要他們出力，以平穩朝局的動盪。朝局穩定之時，朱祁鎮利用石亨、曹吉祥與徐有貞之間的矛盾將徐有貞清理出朝堂。朱祁鎮又一方面故意縱容石亨、曹吉祥，使其氣焰囂張，招惹仇恨，一方面秘密調查石亨、曹吉祥，掌握他們的把柄。朱祁鎮開始對石亨、曹吉祥動手時，先是從石亨的家人身上着手，逐漸解除石亨的兵權，再慢慢擴大並牽連到石亨。石亨一倒，剩下的曹吉祥孤掌難鳴，也只能挺身走險。
朱祁鎮可謂是步步為營，機關算盡。
參考資料：《明史》