科技日報記者 張佳星
日前,有媒體報道馬來西亞衞生部官員聲稱新冠病毒D614G變異毒株的傳播速度可能比一般毒株快10倍。
一石激起千層浪。網友紛紛評論:“本來傳播已經很快了,再變異……”“疫情加速變異、危害加倍擴散”……還有各種支招,諸如“傳播快10倍……給孩子打這個疫苗別晚於10月……”的説法也相繼出現。
這個10倍的説法靠譜嗎?D614G變異究竟會不會使得已經研發的疫苗失效?科技日報記者連線採訪多名國內外病毒學專家,他們表示對“變異讓新冠病毒傳播快10倍”的説法並不認同。
D614G變異與傳播快10倍沒有直接因果關係
D614G變異是指新冠病毒S蛋白的第614號氨基酸由D(天冬氨酸)變為G(甘氨酸)。
“出現D614G變異毒株不是件新鮮事,從我們監控的新冠病毒測序序列數據庫上報情況來看,這個位點的變異很早就出現了。”生物信息數據領域的一位負責人表示,馬來西亞早在3月就出現過D614G變異毒株。
馬來西亞3月已經發現了D614G變異的毒株,而傳播快10倍的相關研究卻是7月份的。這表明,此次馬來西亞官員聲稱的D614G變異與傳播快10倍並不是直接的因果關係。
“我們查找了新冠病毒序列數據庫,馬來西亞的序列最晚是5月底收入的,並沒有這一研究依據的7月份的序列信息。”該負責人表示,僅憑現有的信息和數據,沒有辦法支撐D614G變異使得傳播速度快10倍的結論。如果相關研究真的得出新毒株10倍傳播速度的結論,也不會是D614G變異這一單一原因引起的,而是還有其他未被關注到的原因。
“一些觀點可不可靠、值不值得采信和評論,應該有個判斷標準,比如是不是發表了學術論文。”該負責人提示,經期刊發表的論文不僅有研究方法、詳細數據結論,還經過了同行評議、編輯審評,更有可信度。
科技日報記者發現,被相關媒體用於佐證這一論點的一篇題為《Tracking Changes in SARS-CoV-2 Spike: Evidence that D614G Increases Infectivity of the COVID-19 Virus(新冠病毒S蛋白上的變化:D614G增強傳染力的證據)》的論文中明確表示:D614G變異可能與新冠肺炎患者較高的病毒載量有關,但與疾病嚴重程度無關。這一結論是基於該研究小組對於999名患者的調查獲得的。這一結論卻鮮少在媒體報道中提及。
傳播快10倍不太可能
傳播快10倍,這個數怎麼算?
肯定不可能像給博爾特計時那樣掐表算。
上述文章中採用了臨牀和實驗室方法。
一是根據患者的病毒載量判斷,這裏隱含了一個假設,一個患者攜帶了更多的病毒,傳染力更強。這就好比一麻袋大米撒出去與一小塑料袋大米撒出去,波及的面積前者更大;
另一個是在細胞水平的驗證,通過將變異毒株與原有新冠病毒做對比,比較相同病毒滴度下,感染細胞的數量多少。
針對第一種方法,《細胞》最新在線發表的一篇題為《Making Sense of Mutation: What D614G Means for the COVID-19 Pandemic Remains Unclear(變異的意義:D614G突變對於大流行意味着什麼仍舊不清楚)》的文章中表示:這個假設雖然有道理,但是在實際情況中,一些傳播可能是在前期(無法檢測到病毒)的情況下出現的,因此病毒載量高可能不是傳播潛力的直接反映。
針對第二種方法,該文章表示,在培養過程中測定病毒感染細胞的能力,沒有考慮到其他病毒或宿主蛋白的影響,也沒有考慮到人作為整體與病原體的相互作用。
“由細胞延伸到人,確實有些牽強。”美國加州大學聖地亞哥分校醫學中心副教授李克峯對科技日報表示,更不能通過細胞水平的試驗量化傳播力的大小。
“如果使用動物試驗或許更可信。”李克峯説,但需要構建新冠病毒相關的模型動物,在摸清發病規律的基礎上,經過嚴密的試驗設計,計算感染率和病死率,獲得更可信的結論。由於細胞實驗出結論快,大家急於發表,但會使得結論的可靠性大打折扣。
從另一個角度判斷這一結論將是誇張:新冠病毒R0值大概在3—4,傳播快十倍,意味着R0值要達到30—40,這在目前人類認知的傳染性疾病中幾乎不存在。(注:R0值表明一個病人可以傳染給幾個人)
變異確實存在,影響疫苗可能性小
“根據現有的8萬多條新冠病毒序列的分析表明,D614G變異的病毒序列數達到約80%。”生物信息數據領域的該名負責人表示,排除一些測序但沒有公開收錄的情況,基本可以得出這類變異已成主導的結論。
可見,新冠病毒確實變化了,那這種變異會帶來什麼呢?
正如上面提到的“變異的意義”一文標題中總結的:D614G突變對於大流行意味着什麼仍舊不清楚。但該文章同時認為:無論是2013年至2016年埃博拉疫情的經驗、還是基於體外感染性等數據,都表明不可能得出僅一個突變就對大量、多樣化人羣產生重大影響的結論。
也就是説,僅憑一個突變產生重大影響不可能。
4月10日在國藥集團中國生物新冠疫苗生產基地拍攝的新型冠狀病毒滅活疫苗樣品。圖片來源:新華社
對於新冠病毒變化的總結應該是立體的,不應只關注傳播速度。例如有研究者根據一些國家新冠疫情的數據蒐集和歸納分析,總結有些國家兒童感染率急劇增高,重症人數在急劇減少等特點。
關於D614G突變會不會影響疫苗效果的問題,上述相關負責人解釋,614號位點雖然在S蛋白(該蛋白被認為是病毒進入人體的“鑰匙”)上,但並不在S蛋白的疫苗靶向區上。
怎麼理解呢?可以理解為它可能在“鑰匙柄”上,而目前的疫苗設計多以S蛋白的功能區為依據,例如我國的重組蛋白疫苗選取了S蛋白的核心片段,在能夠產生免疫效果的前提下,重組蛋白片段越小疫苗副作用也越小。
據相關文獻顯示,S蛋白的614號氨基酸位於棘狀蛋白原聚體的表面,根據蛋白的立體構象,與相鄰的啓動子形成關聯。由於蛋白是一個立體結構,一個位點的變化也可能導致蛋白結構的調整,因此變異產生的效果仍需跟進。
相關研究者表示,如果上傳序列中能夠包含該序列所來源患者是否死亡、是無症狀感染者還是輕症患者等信息,將能夠幫助生物信息學者獲得更有用的、更接近真實世界的分析。