11月9日，在俄羅斯的協調下，亞美尼亞、阿塞拜疆同意在納卡停火，隨後俄羅斯1960名軍人進入衝突之地，監督停火。協議簽署預示着長達40多天的衝突結束，亞美尼亞不再受到戰爭侵擾，因為這場衝突，亞美尼亞在實力對比懸殊的情況下已經造成了巨大的傷亡，總理帕希尼揚的妻子、兒子都衝向戰場，當然衝突結束，亞美尼亞控制的納卡地區又少了一些領土，俄羅斯調停衝突，避免了戰事擴大，避免了亞阿雙方進一步傷亡。
但在俄主導停火，並派出維和軍人監督之下，亞美尼亞首都埃裏温卻爆發了持續的抗議活動，數棟政府大樓遭到破壞，抗議對準亞美尼亞總理，指責其簽署喪權辱國條約，完全忽視了這場衝突中亞美尼亞所處的劣勢。
據俄羅斯情報部門顯示，美歐正同時刺激亞阿兩國的民族主義者，他們試圖讓亞美尼亞人相信，納卡停火是亞美尼亞政府的失敗，同時，他們又在刺激阿塞拜疆的民族主義分子，告訴他們“阿塞拜疆的勝利被俄羅斯偷走了”，特別是“當阿塞拜疆距離佔領納卡首府實斯捷潘納克特只有一步之遙時”。亞美尼亞民眾將矛頭指向調停者俄羅斯，許多亞美尼亞士兵拒絕從納卡地區撤軍，認為自己“遭到了背叛”，正準備在納卡打游擊。另外亞美尼亞軍人拒絕撤出納卡地區，拒絕執行停火協議，甚至有納卡地區軍人向維和的俄軍開槍。還有報道稱，亞美尼亞除了割地之外，還需要承擔500億美元的賠償，這也是一個巨大的負擔，相當於亞美尼亞GDP的4倍以上。
為了應付抗議的民眾，亞美尼亞總理11月18日，聲稱對納卡失敗負責，同時在社交媒體上提出了自己的15個行動計劃。他表示，希望在歐安組織明斯克小組的主持下，恢復關於納卡問題的正式談判進程。
納卡調停由俄羅斯主導，帕希尼揚卻要引來歐安組織主持和平，顯然普京低估了帕希尼揚。
納卡衝突爆發後，亞美尼亞對外求援的第一個電話打給了美國，結果美國根本就無暇顧忌，面對比自己實力強大得多的由土耳其強力支持阿塞拜疆，亞美尼亞想到了自己還是集安組織成員，於是連打了多個電話，向普京求援，普京表示，納卡不屬於亞美尼亞領土，所以不受集安組織保護，但卻一直在幕後做着調停工作，普京聲稱，若帕尼希揚若早些時候答應阿塞拜疆的要求，可能一個月前衝突已經結束了，亞美尼亞不至於損失這麼多，而且死亡這麼多人。
此次停火協議的簽署，其中有一個主要原因是阿塞拜疆擊落了俄羅斯米-24直升機，阿塞拜疆自知理虧的情況下答應俄羅斯的停火要求，最終達成停火協議，俄羅斯維和軍隊開進納卡衝突之地，監督停火。可以説不是俄羅斯從中協調，亞美尼亞可能傷亡更大，損失更大，現在在俄羅斯調停之下 ，納卡衝突停火之時，亞美尼亞一方面又責怪俄羅斯出手太晚了，而且出賣了自己。
同時在俄羅斯維持的和平之下，亞美尼亞總理還要邀請歐安組織來調停，這顯然是對俄羅斯不信任。亞美尼亞總理這是朝三暮四，他似乎忘記了俄羅斯才是真心幫助自己的國家，而納卡衝突期間，美歐更多的是出來觀望，不會付出實際行動。
在俄羅斯調停之下，帕希尼揚想拉歐美來調解，只不過是拜錯了廟，燒錯了香，俄羅斯普京已經向亞美尼亞提出警告，這説明普京早已心知肚明。不過這亞美尼亞享受着俄軍帶來的和平，卻想拉美歐來調停，普京顯然也低估了亞美尼亞總理帕希尼揚。