8月26日晚間，牧原股份對外發布2021年半年度業績報告。數據顯示，在2021年上半年，牧原股份的營業收入約為415.38億元，同比增加97.49%；歸屬於上市公司股東的淨利潤約為95.26億元，同比減少11.67%。
受此消息影響，牧原股份8月27日股價有所走弱。截至當日收盤，該公司股價下跌1.47%至42.92元/股，總市值為2259億元，較2021年2月最高值是跌去一半以上。
牧原股份表示，生豬價格明顯回落是淨利潤下降的主要原因。隨着生豬出欄量持續恢復，2021年以來，生豬市場價格持續回落，6月份生豬價格出現快速下跌。
此外，在利潤下滑的同時，2021年3月，牧原股份又被捲入“財務造假”風波。
2021年3月13日，有網絡公眾人物發文稱牧原股份財務存在疑點並疑似造假，其質疑部分主要集中在以下三點：
1、牧原股份的固定資產太高，幾乎與銷售收入相當，固定資產佔銷售收入的比重遠高於同行業其他上市公司。
2、牧原股份與控股股東旗下建築公司存在大量的關聯交易（過去兩年約190億元），暗指承建豬圈的牧原建築從上市公司賺了大錢。
3、少數股東ROE遠低於母公司股東ROE，少數股東的ROE僅為13.98%，而歸屬母公司股東的ROE卻高達47.88%，相當於這些少數股東在同上市公司做不掙錢的合夥生意。
針對此事，3月15日，牧原股份回應稱，該公司經營一切正常，對網上質疑目前尚未有公開回應，與控股股東旗下建築公司的關聯交易也屬正常。
在5月12日，牧原股份對外發布公告稱，該公司已於近日收到中國證監會下發的對其法定代表人兼董事長秦英林採取監管談話措施的決定。
對此，證監會認為，牧原股份的上述行為違反了《上市公司證券發行管理辦法》(證監會令第163號)第四十八條的規定。依據該規定，上市公司發行證券前發生重大事項的，應暫緩發行，並及時報告中國證監會。在證監會看來，上述較大的負面輿論和深交所的問詢，屬於對這次發行條件構成重大影響的事項。
牧原集團始建於1992年，主營生豬養殖業務，併兼有飼料加工、生豬育種、生豬屠宰等業務協同主業發展。該公司旗下牧原股份成立於2000年，並於2014年1月在深交所上市。
此外，牧原股份作為生豬行業的龍頭企業，在2019年出欄生豬1025萬頭，規模化養殖全國第一，約為第二名的兩倍。在生豬以及相關製品行業，除了牧原股份外，玩家還包括正邦科技、温氏股份、新希望等上市公司，以及包括恆大、碧桂園、萬科、中糧、華潤、綠城等一眾宣佈進軍豬市的房地產企業。