二戰結束後兩三年，蘇聯掀起了一場全國性反猶太人運動，大批猶太人遭到迫害。這場運動的發生與蘇聯領導人斯大林本人的排猶情緒不無關係。由於各種原因，斯大林比較嫌惡猶太人。據赫魯曉夫回憶，斯大林“對猶太民族的態度很不友善”;斯大林的女兒斯韋特蘭娜也回憶説，“父親覺得到處都是‘猶太復國主義’，到處都有陰謀。”可斯大林的親戚中偏偏就有不少猶太人，這讓他無奈又頭痛。
兒子的猶太妻子
斯大林的第一任妻子斯瓦尼澤死於1908年，給丈夫留下一個1歲的兒子雅科夫，由斯瓦尼澤的姐妹們撫養。1921年，雅科夫抵達莫斯科開始同斯大林的新家庭一起生活。中學畢業後，雅科夫去了列寧格勒並在那裏結婚，不過這樁婚姻很快解體。1935年，雅科夫在莫斯科結識了年輕漂亮的猶太人尤莉婭。
尤莉婭從烏克蘭來到莫斯科本是尋求幫助的，因為她的丈夫———內務人民委員部的一名基層官員被捕了。她找到斯大林第二任妻子的姐姐安娜·阿利盧耶娃，因為她的丈夫是安娜的丈夫列堅斯的朋友。尤莉婭丈夫的命運最終不是很清楚，不排除在列堅斯的幫助下獲釋並被打發到外省去了。而尤莉婭本人在結識了權貴們之後，認為留在莫斯科比較好。正是安娜介紹了雅科夫同尤莉婭相識，並促成了他們的結合。
斯大林的一位親戚瑪麗婭·斯瓦尼澤在1935年11月17日的日記中這樣記述這樁婚姻：“……雅沙(雅科夫的小名)第二次步入的是同尤莉婭……的婚姻。她是一位可人的30—32歲的女士，很嬌媚……雅沙是她的第三任或者第四任丈夫。她比他大。我不知道И.將會怎樣對待此事。”此處的“И.”，指的是約瑟夫·斯大林。出版於1967年的斯大林女兒斯韋特蘭娜的回憶錄則記述道：“尤莉婭是一個猶太人”，“這引起了父親的不滿”。但斯大林沒有干預。
斯大林兒子雅科夫
1938年，雅科夫的女兒———斯大林的孫女加莉婭誕生。1941年7月，雅科夫在戰場上被德軍俘虜時，他的妻子尤莉婭在蘇聯遭到逮捕，女兒加莉婭則被送進保育院。正是在這個前線潰敗的時期，斯大林簽署了一道命令：“……被俘的指揮官應當被看做是惡毒的逃兵，其家人就是違背誓言、出賣祖國的逃兵家屬，應予以逮捕。”對於自己兒子的家屬，斯大林也沒有例外。直到1943年雅科夫在德國戰俘營裏死去之後，他的妻子尤莉婭才獲釋。
女兒的猶太情人和丈夫
斯大林最疼愛的女兒斯韋特蘭娜也沒讓父親省心。斯韋特蘭娜年僅16歲時，結識了電影導演卡普列爾，兩人很快擦出愛情的火花，而此時卡普列爾已經38歲。卡普列爾的資料很快被報給斯大林：猶太人，有婦之夫，每天混跡在一幫女演員中間，有很多情人和崇拜者。
此外，卡普列爾很招搖，並不止一次到過國外。蘇聯內務人民委員部認為卡普列爾與斯韋特蘭娜之間過於密切的友誼是不可容許的，卡普列爾被正式警告：不要打攪斯韋特蘭娜平靜的生活!但卡普列爾把警告當成耳旁風。最終，他遭到逮捕，流放5年。斯韋特蘭娜本人也遭到父親訓斥：“……你瞧瞧你自己———你需要誰?!他身邊有一圈的娘們!”
1944年春天,斯韋特蘭娜結婚了。“我出嫁了。我的第一任丈夫……是一個猶太人，並且這一點不能令我的父親感到滿意”，斯韋特蘭娜在回憶錄中寫道，“父親只堅持一點———讓我的丈夫不要在他的家裏出現……”1945年6月，斯韋特蘭娜生了一個兒子，一直到若干年後，斯大林才跟外孫見面，但從沒同自己的女婿莫羅佐夫碰過面。
斯韋特蘭娜的婚姻僅持續3年就破裂了，表面上是“由於個性的原因”，實際上問題出在斯大林的親家公身上。這位親家公出生於一個猶太家庭，沒有什麼革命功勳，最初基本是經商，後來在國家機關謀得一個會計員職位，生活很儉樸。自從兒子同斯大林的女兒結了婚，他就假扮成一個老布爾什維克和老教授，躋身上流社會圈子，同蘇聯黨和國務活動家以及老布爾什維克們頻頻會面。他總會不經意地提到自己似乎經常同斯大林會面，斯大林總是定期邀請他去克里姆林宮，但事實上斯大林從未見過他。斯大林獲悉這些情況之後極其惱怒。1948年2月，這位親家公因“誹謗蘇維埃國家領導人”而被捕並被判處15年監禁。
斯大林猶太親屬的命運
斯大林第二任妻子娜·阿利盧耶娃的哥哥帕維爾，1938年曾在莫斯科裝甲坦克軍指揮部服役，從索契休假歸來之後出人意料地死在莫斯科，留下妻子Е.А.阿利盧耶娃和3個孩子。若干個月之後，Е.А.阿利盧耶娃重新嫁人，新丈夫叫莫洛奇尼科夫。斯大林對這樁婚姻不滿，首先是因為婚姻進展太急速。按照格魯吉亞習俗，失去丈夫的妻子應當服喪若干年並得到親戚們的許可之後才可以進行新的婚姻。此外，莫洛奇尼科夫是一個猶太人，並且多次到過國外。
1947年底，西方報刊披露了有關斯大林家庭生活的一些情況，特別是刊登了有關他的第二任妻子1932年死於自殺的一些情況，這讓斯大林非常震怒，因為蘇聯官方一直聲稱娜·阿利盧耶娃死於闌尾炎急性發作併發腹膜炎。蘇聯國家安全部受命調查，斯大林的很多親屬的住宅和電話受到監視和竊聽。最初的懷疑落到娜·阿利盧耶娃的姐姐安娜以及哥哥帕維爾的妻子兩個家庭頭上。安娜於1946年出版的回憶錄難免會提及妹夫斯大林的一些情況，此外她在講授革命史課程的過程中不得不對聽眾們提出的問題作出回應和解答。1947年5月，她的回憶錄遭到《真理報》尖鋭批評，並且被禁止發行、傳播，她本人則被停止授課。
1947年12月初，Е.А.阿利盧耶娃遭到逮捕，她被指控從事反蘇勾當並且傳播了關於蘇聯政府首腦的流言蜚語。若干天后，她的丈夫也被逮捕。此後，他們朋友圈子中的很多猶太人陸續被捕，在嚴刑拷打之下他們供認是根據蘇聯猶太人反法西斯委員會主席米霍埃爾斯的請求，收集斯大林的家庭生活情況的。
根據這些供詞，蘇聯國家安全部認定，是娜·阿利盧耶娃的親屬們將斯大林家庭生活的秘密泄露出去的。最終，Е.А.阿利盧耶娃夫妻被判10年監禁。1948年1月，安娜·阿利盧耶娃也被逮捕、判處10年監禁。他們本人並不知曉，他們的被捕居然會成為隨後不久蘇聯領導人發動的一場波及蘇聯全國的反猶太人運動的導火索。