腦外傷後睡眠障礙是十分常見的可能會影響康復和對認知功能造成不良的影響。睡眠障礙的發生率在30％~70％之間取決於外傷後時間和診斷標準。急性期睡眠障礙的發生率最高但慢性睡眠問題的患者也很多。最初的外傷可能導致對調整睡眠具有重要作用的神經元結構受損諸如網狀激活系統等。
在急性期環境、藥物、疼痛、應激、認知缺陷和行為問題都可能會導致睡眠障礙但適應不良的行為和想法可能發展並導致這些睡眠問題的持續存在。諸如阻塞性睡眠呼吸暫停、不寧腿綜合徵等特異性睡眠障礙可能在腦外傷前就已存在無論是否知曉可能都需要治療。
失眠的非藥物治療主要包括改變環境、放鬆技術和行為治療等。許多藥物也可用來治療失眠如：苯二氮卓類、抗抑鬱類(尤其是三環類抗抑鬱劑)和非苯二氮卓類鎮靜劑。所有這些藥物都有潛在的認知方面的副作用用於腦損傷後康復患者前須仔細權衡利弊。無論何時發現睡眠障礙或開始治療客觀地評定所採用的治療的療效是重要的因為患者自述可能是不準確的。