在《隊長小翼：新秀崛起》的設置菜單中，可以調節的內容包括以下。
COM等級：電腦的等級分一星、二星、三星。星數越少越弱。
比賽時間（半場）：半場時間可以選8種，分別是4 / 5 / 6 / 7 / 8 / 10 / 15 / 20，數字對應的是真實時間。
加時賽：相同比分到比賽時間結束時，有沒有加時賽的設定。
PK戰：相同比分到比賽時間結束時，有沒有PK戰的設定。
選手交換人數：一場比賽中選手交換的上限人數，可以設定4種，分別是3 / 4 / 5 / 6。
賽場：可以設定的賽場包括南葛中學球場，東邦學園球場，武藏中學球場，富良野中學球場，南葛市綜合運動場，琦玉世界球場，琦玉世界球場副球場，星冠球場，星冠球場副球場，共9種。
時間：比賽的時間有白天，傍晚，晚上三種設定。
用球類型：足球類型有國內比賽用，國際比賽用，隨機三種選擇。
攝像機類型：攝像機有拉近，適中，廣角三種設置。
聲音設定
鍵位設定：可以調整手柄鍵位，但是NS分手柄遊戲時的鍵位設置不可以進行調整。
數據使用的狀態：默認情況設置是打開，會發送遊戲進行的情報。玩家可以自行關閉。
其他設定：跳過劇情和跳過交流劇情，可以設定不跳過，跳過既讀，跳過全部三種。