世界首款大麥高密度液相單核苷酸多態性芯片研發成功
本文轉自【央視新聞客户端】;
近日,世界首款大麥高密度液相單核苷酸多態性芯片在西北農林科技大學研發成功,這是基於我國青藏高原特有的裸大麥也就是青稞研發的世界首款大麥液態芯片。這款新型芯片突破了以往全球大麥芯片缺乏我國種質資源基因組信息的瓶頸,儲存了40519個大麥遺傳信息,為選育優良大麥品種提供了強力支撐。
目前市場上的用於理論和育種研究的大麥芯片產自歐美,並且多是傳統的固相芯片,在使用成本、通量、靈活性等方面都不如新一代液相芯片。同時這些芯片不包含野生材料基因組信息,也沒有我國大麥尤其是青稞的基因組信息,在覆蓋基因組的深度和廣度不如新一代大麥液相芯片。
來自西北農林科技大學的宋衞寧教授團隊基於對來自全球不同生態區、不同類型的155份大麥材料的全基因組數據,從海量單核苷酸多態性數據集中挑選了代表性強、多態性高的位點信息,整合已鑑定的數百個重要性狀相關位點信息,成功開發了世界首款大麥高密度液相芯片。
大麥是全球位居第四的重要禾本科作物,能夠在乾旱、鹽鹼等嚴酷環境中種植。除了人畜食用外,還是食品和飲料工業廣泛使用的重要原料。在我國青藏高原,青稞也就是裸大麥具有極其重要經濟和文化價值。我國的大麥育種急需這樣精準高效的芯片利器,農為國本,種為農先,新型大麥芯片在大麥分子育種、設計育種和理論研究方面具有廣闊的應用前景,目前該項研究已申請專利(總枱央視記者 閆星光 孟濤 )