2020-21賽季CBA常規賽第31輪，同曦男籃迎戰新疆男籃，第三節還剩下2分多鐘時，新疆男籃進行，莫泰尤納斯在罰球線內傳內，高調給籃下的周琦，同曦男籃孫思堯繞前防守周琦，跳起來試圖斷球時，身體失去平衡向後倒去，身體的重量撞到了周琦的膝蓋部位。身高比較高的輕型中鋒，腿部肌肉力量對關節和韌帶的保護能力有限，最怕這樣的側向擊中膝關節部位，形成膝關節側向屈伸，非常容易傷到的就是側副韌帶，所以周琦痛苦倒地捂着自己的傷處，遲遲無法起身。
隊醫在場邊緊急處理後，周琦被6名新疆球員和工作人員抬離了場地，直接返回更衣室。之後，周琦跟隨球隊的大巴一起返回酒店，雖然顯得一瘸一拐，但能夠自己行走，不用扶，據初步診斷，周琦基本排除其前叉韌帶受傷的可能，為膝關節側副韌帶拉傷，需靜養、恢復一段時間，問題不大，但是周琦被抬出場賽後也引發了不小的爭議，當時周琦膝蓋附近受傷，不能行動，現場沒有使用擔架，而是由新疆隊工作人員合力抬回更衣室，很清楚的可以看到有工作人員還抬着周琦的受傷腿的部位。
這個做法實在不妥，出於保護球員的做法，應該用擔架抬出場，引發了球迷的不滿，作為周琦的經紀人，睢冉更是在微博發文噴CBA聯賽業餘：“職業聯賽，業餘到令人髮指！q ”睢冉在微博上説道。4個小時之後，CBA聯賽官方發佈了一條微博，回應了球迷們和睢冉的質疑，微博中寫道，每場比賽場邊都有由醫生、護士和救護車司機組成的三人醫療小組，並配備了擔架車和其它所需的急救用品，如果有球員受傷，由隊醫或者裁判發出讓醫護人員進場的信號。
如果球員傷得不是特別重，現場一般由隊醫決定是否使用擔架入場，很顯然，CBA官方把鍋給了新疆隊醫，作為新疆男籃內線核心，周琦本賽季代表新疆男籃出戰27場比賽，場均上場33.4分鐘，得到21分11.6個籃板3.3次助攻2.4次蓋帽。在外援莫泰尤納斯歸隊前，周琦的場均出場時間為全隊第二高，近期因為體能狀況，個人狀態有些萎靡，同時也增加了自己受傷的風險，希望周琦儘快康復的同時，增加自己的體能耐力，而主教練也要合理的使用周琦，畢竟高大中鋒恢復起來確實要比後衞慢一些。