有的怪獸來自宇宙，有的怪獸是因為變異，而有的怪獸則在很早很早之前就存在於地球上，比如古代怪獸哥莫拉。研究人員發現了哥莫拉，並且想方設法想要將它運回日本。但是在運送的過程中，卻出現了意外，讓哥莫拉逃走了。等到怪獸再次出現的時候，奧特曼也來了，到那時神奇的是，奧特曼和怪獸正在戰鬥的時候，變身器卻從天而降，還被一個小孩撿到了。哥莫拉最後還是逃走了，沒有了變身器的早田，又該怎麼辦呢？
在本集的開頭就講到，有一個小孩子非常喜歡怪獸，並且還被人稱為怪獸的研究者。但是身邊的小夥伴都咋嘲笑他，認為不可能有怪獸存在。後來小男孩將自己獲獎的怪獸畫作拿給媽媽看，連媽媽都在讓他畫別的東西。
與此同時，嵐隊員和其他研究人員正在深山裏考察，他們還遭遇了奇怪的植物攻擊。（這種植物看起來很眼熟，難道是之前皮克蒙出現的地方？）有一名研究人員被困，嵐隊員隨即用小型射線炮幫助核名人員脱困。突然，有一聲怪獸的叫聲。
原來，在一座山裏，有一頭怪獸破土而出，它就是哥莫拉。當嵐隊員要準備射擊的時候，被博士阻止了，並且提出了要將哥莫拉運回日本的想法。同時，這個消息還被各大報紙報道。也被小男孩看到，並且將哥莫拉的照片剪下來，帶去學校。
小男孩還憑藉着自己的想象，將哥莫拉全身圖畫了出來，並且被同學們稱為怪獸殿下。而此時，科特隊那邊也有了進展，他們打算用進口的麻醉藥，將哥莫拉麻醉，之後用三架威託帶着哥莫拉飛回來。但是，意外卻出現了，由於環境的因素，哥莫拉比預計的時間早醒。
沒辦法，科特隊只能將哥莫拉扔進深山裏。從兩千多米的高空扔下來，原本一位怪獸會死，那些小孩子也這麼想，但是怪獸殿下並不相信，和另外一名小孩子去了哥莫拉被丟下的地方。在那裏，他們偶遇了早田，並且將孩子們送回了家裏。由於距離城市比較近，科特隊打算消滅怪獸。但是哥莫拉一溜煙，鑽進地底，不見了。
等到哥莫拉再次出現的時候，小男孩也在場，並且在現場大喊“奧特曼”。神奇的是，這一次並沒有科特隊的攻擊，而是奧特曼直接就出現了。奧特曼和怪獸陷入戰鬥，突然，有什麼東西掉在了小男孩的面前。
原來是早田進的貝塔魔棒。當奧特曼在和怪獸戰鬥的時候，哥莫拉一直不斷用尾巴在攻擊奧特曼，難道把奧特曼的變身器拍出來了？小男孩撿到變身器，還很高興地拿着大喊：奧特曼！
初代奧特曼一時間招架不住哥莫拉的尾巴，彩色計時器你也變成紅色的。當奧特曼擺出姿勢要發射斯派修姆光線時，哥莫拉一尾巴又抽了過來。奧特曼實在沒有力氣再戰鬥了，只能眼睜睜的看着哥莫拉鑽進地底，又不見了。
本集在小男孩的叫喊聲中結尾了。不知道的估計還以為他要變成奧特曼了。