1570年6月，奧斯曼帝國軍隊入侵威尼斯統治下的塞普勒斯，第二年1月佔領了全島大部並圍困了僅剩的孤城法馬古斯塔。8月1日，在得到可以自由離開塞普勒斯的承諾後，法馬古斯塔的威尼斯守軍投降。之後，奧斯曼軍隊指揮官拉拉·穆斯塔法·帕夏食言並囚禁了威尼斯人。8月17日，威尼斯指揮官馬可·布拉加丁被活剝了皮。他的屍體，以及其他將領的頭顱被掛在拉拉·穆斯塔法·帕夏的槳帆船上。圖為位於威尼斯的布拉加丁之墓。
在法馬古斯塔受包圍後，在教宗庇護五世的倡導下，歐洲天主教國家共同組建神聖同盟以救援法馬古斯塔。包括威尼斯共和國，西班牙帝國，熱那亞共和國，聖約翰騎士團，托斯卡納大公國，薩伏依公國，烏爾比諾公國，帕爾馬公國等天主教國家加入了神聖同盟。西班牙為同盟提供了大部分資金，而威尼斯是同盟船隻的主要供應者。西班牙國王腓力二世的同父異母弟，其父查理五世的私生子奧地利的唐胡安（圖）被任命為同盟艦隊司令。
1571年7月，神聖同盟艦隊抵達事先約定的艦隊集結地墨西拿。8月艦隊出發，橫越亞得里亞海後沿著海岸緩慢航行。同時，奧斯曼艦隊也被派出行動以阻止同盟艦隊援救塞普勒斯。與往常不同，奧斯曼帝國高層要求艦隊將領主動進攻敵軍艦隊。1571年春，奧斯曼艦隊司令穆阿津扎德·阿里·帕夏（圖）率艦隊主力出發，在成功襲擊了克里特和亞得里亞海沿岸的威尼斯領土後，土耳其艦隊於9月底抵達勒班陀港並下錨停泊。
10月4日，神聖同盟艦隊抵達了凱法利尼亞島，在當地得知了法馬古斯塔失陷和布拉加丁被殘忍處死的訊息。唐胡安認為有必要主動進攻以維護同盟內部的團結。10月6日黃昏，天氣轉晴。當晚，同盟艦隊駛往帕特拉斯灣入口，試圖引誘土耳其人出擊。同時，土軍司令阿里帕夏也不斷收到伊斯坦布林要求他主動出擊的命令。6日晚阿里帕夏召開作戰會議，大部分將領反對出擊，但在高層命令的壓力之下，阿里帕夏最終決定出擊。
1571年10月7日黎明時分，向帕特拉斯灣內航行的神聖同盟艦隊發現了出擊的奧斯曼艦隊,唐胡安在國王號上召開了作戰會議並決定迎戰。奧斯曼艦隊也在同一時間段發現了同盟艦隊。正午將至時，兩軍相隔已經僅有4英里遠。阿里帕夏的旗艦蘇丹娜號鳴炮挑戰，唐胡安所在的旗艦國王號鳴炮回應，兩艘旗艦升起旗幟。戰役正式展開。
午後時分，兩軍的中路艦隊也開始交戰。神聖同盟艦隊待敵艦抵近後才開炮攻擊，對土軍艦隊造成極大損傷。蘇丹娜號徑直撞向了國王號，隨後兩艘旗艦間爆發了激戰。奧斯曼人一度佔據了優勢，大量士兵湧上了國王號。但同盟的預備隊及時支援，穩定了同盟艦隊戰線。在海戰史上，勒班陀戰役標誌著歷史上最後一場以槳帆船為主的大型海戰。這場戰役在本質上是一場“甲板上的步兵戰鬥”。
同盟艦隊逐漸取得了優勢，馬爾坎託尼奧·科羅納支援國王號，擊退了奧斯曼士兵並發動反攻，土軍艦隊司令阿里·帕夏被火繩槍殺死，首級掛在長矛示眾，哈里發帥旗被奪，導致奧斯曼軍隊士氣崩潰最終戰敗。蘇丹娜號上全體船員悉數陣亡，船隻被同盟士兵奪取。神聖同盟的旗幟升上了蘇丹娜號的桅頂，周邊的土軍紛紛崩潰。兩小時戰鬥後，右翼和中路的奧斯曼艦隊已經被擊敗，儘管戰鬥還將持續兩小時。
神聖同盟的勝利對歐洲和和奧斯曼帝國的歷史具有重要影響。勒班陀戰役成為了奧斯曼帝國在地中海軍事擴張的轉折點，儘管奧斯曼帝國的擴張之後仍延續了一個世紀。戰役勝利的訊息很快在全歐掀起了巨大反響。羅馬和威尼斯的街頭上舉辦了盛大的慶祝活動。神聖同盟將勝利歸功於聖母瑪利亞。教宗庇護五世將10月7日定為勝利聖母節，後來這一天成為了天主教會的玫瑰聖母節。