隋煬帝在江都的酒池肉林中醉死，天下紛亂漸顯，群盜縱橫，逆胡猖獗。李淵一聲令下，欲挽天河，一洗中原膏血，一路披荊斬棘建立李唐王朝。
李淵麾下大將層出不窮，榮登大位的李淵，給予每個開國功臣權利與財富，但不敢委以重任，而李孝恭卻成為了朝中的肱骨，這又是為什麼呢？
李淵與李孝恭為一族血脈
武德元年（618年），李淵在爽朗秋風中，踏著滿地丹楓，走進皇宮，昭告天下今後由李家主導，群臣跪拜。下朝後，李淵單獨把李孝恭留下，敘述家常。
李家世代都是將門世家，李孝恭和李淵二人是同宗同族的血緣至親。西魏以赫赫戰功聞名於世的李虎，是二人的祖父，號稱西魏“八柱國”之一，權位榮盛，朝中無人能夠與之相匹敵。
李淵的父親李昺，是李虎的第三子，性情至孝，文化武功基本無一不通，且好學有容人的雅量。李虎過世之後，承襲隴西郡公的位置，李昺特別賞識自己的弟弟——李蔚，所以李蔚所出的李孝恭，自小就和李昺孩子——李淵感情十分要好。
李淵在說完家常話之後，才引入正題：“天下未亂蜀先亂，天下已定蜀未定，臣弟啊，寡人實在是不知該把這個難題交給誰啊？心中自覺唯有弟弟，你能夠幫助我收服蜀地，望臣弟別拒絕我的請求。”
李孝恭一聽，馬上單膝跪地，豪氣萬丈地說：“臣弟一定不辱使命，幫助哥哥收復天下。”李淵熱淚盈眶，握著李孝恭的手久久不放。
次日，李淵親自送李孝恭出征，李孝恭拜為信州總管，當時統領巴蜀地區的是朱粲，這個朱粲可不是什麼良善之輩。
朱粲出生於安徽毫州，讀過幾天書，年紀輕輕就已然透過關係，成為縣中佐吏，且行事極為詭詐。隋末天下大亂，朱粲看到飛黃騰達的機會，假意參加義軍，在軍中暗中勾結，趁亂帶著他的親信逃亡，自稱迦樓羅王。朱粲率領的大軍所到之處，不過幾日便渺無人煙。
他不但容許部下打家劫舍，搶佔民女，而且有吃人的惡癖，被稱為“兇惡之賊”。李孝恭到達蜀地之前，就已經將朱粲相關資訊瞭解透徹。
同年十月，巴山楚水淒涼地，白帝城邊一片肅殺，李孝恭派遣鄧州刺史——呂子臧聯合馬元規，將朱粲大軍擊敗。但因為兩位將領意見不合，給了朱粲重整旗鼓的機會，朱粲趁機圍攻呂子臧和馬元規駐守的南陽城，兩位大將雙雙戰死。
李孝恭震怒，親自率領大軍前往白帝城，朱粲大軍力不能及，很快敗下陣來。朱粲經過一番偽裝後趁亂逃跑，留下大軍接受制裁。
李孝恭手下表示，朱粲部隊已然是食人的惡賊，應該全部予以活體掩埋，才能對得起被食用人的生魂。李孝恭仔細沉思並未採用該手下的意見，他覺得他們已然在此地有自己的部眾，如果直接坑殺這些俘虜，必然引起還在白帝城中堅守的人的抵抗，這樣就加大了收服的難度。
李孝恭最終以“只斬賊首”為理由，將俘虜送回到白帝城中。李孝恭此舉果然受到了巴蜀人的敬意，城中百姓認為李孝恭必然是一個不同於朱粲這種惡人的良善之輩，歸順李氏王朝應該能夠安居樂業。於是，李孝恭輕易就將巴蜀收服。
再獻良策，親滅蕭銑
武德三年（620年），李孝恭在詳盡考察過國家局勢之後，向李淵獻策，決意蕩平割據江南富庶之地的蕭銑。李淵也早有這個想法，只不過當時局勢還不是很穩定，現在也確實是好時候，李孝恭的計策正合他意，李淵表示撥馬匹、精兵上萬助力李孝恭。
李孝恭是一個很能收服人心的將領，他在離開巴蜀班師回朝之前，將巴蜀幾乎所有首領的兒子，都收歸到自己的部隊裡，帶著他們一起斬獲赫赫戰功。此舉不但向巴蜀首領，表示了自己對諸位首領的厚愛，同時也隱含著李孝恭的深意——帶走所有首領的兒子，相當於手上有控制巴蜀首領的籌碼。
李孝恭從來都不會打無準備之仗，在行軍到夷陵的路上，李孝恭就不斷和幕僚討論，如何又快又穩地攻破蕭銑大軍。
武德四年（公元621年），李孝恭著急進攻，不想被蕭銑大將文士弘擊敗。李孝恭暫退清江南岸，文士弘獲勝後，驕傲自滿，默許士兵四處搶掠。李孝恭手下的副將李靖見此，趁亂指揮手下精兵，將文士弘軍一舉殲滅，可謂是出其不意。
蕭銑軍隊節節敗退，很快就不能承受李孝恭軍的鞭撻。蕭銑早就聽聞李孝恭在巴蜀的美名，再三權衡之下，決定選擇舉兵出城投降。蕭銑也並不是一個完全無能之輩，他心繫屬地百姓，向李孝恭提出最後一個要求：百姓是無辜的，望李大將軍部下不可亂動殺伐。李孝恭親自解下蕭銑的手上枷鎖，斟上一杯松醪酒，點頭答應。
李孝恭將蕭銑囚車送達京城大牢，並吩咐大牢中人善待蕭銑。蕭銑拜倒在李孝恭腳下之後，嶺南四十九州的首領，也紛紛向李孝恭舉兵投降，城上掛起了李唐大旗。
李孝恭平滅蕭銑之後，官至荊州大總管，李孝恭和手下將荊州大小事務治理妥當，大力開置屯田，幫助百姓煉製銅器，便利百姓開墾良田，不久又被升任為襄州道行臺左僕射。 武德六年（623年），被李淵封為吳王的杜伏威手下——輔公祏，受奸人蠱惑，起兵謀反。
隋末唐初， 輔公祏本和杜伏威二人拜為兄弟起兵反隋。在血戰之下，二人勢力逐漸強大，杜伏威在歷陽安營紮寨，自稱為歷陽大總管，輔公祏被任命為長史。武德二年（619年）杜伏威和輔公祏決定歸附李氏王朝，並且命杜伏威二人攻打李子通。
二人是亂世年間的生死之交，但安居一隅之後，反而頻生嫌隙。杜伏威開始對輔公祏產生不必要的猜忌，再三的試探讓輔公祏坐立難安。
武德六年（623年），杜伏威入朝，留下輔公祏守衛丹陽。杜伏威走後，輔公祏反手起兵謀反，自稱為帝，國號為宋。
李孝恭聽聞此事，立馬領兵直抵丹陽，很快就將輔公祏斬於馬下。在出發前往丹陽之前，李孝恭群宴士兵，在眾目睽睽之下，李孝恭的酒不知為何就逐漸變紅，猶如血水一般駭人。
在座將領噤聲不語，李孝恭看到之後，將杯中血水一飲而盡，說：“禍福相依，幸運從來都靠自己創造，我又不是那種反賊，各位將軍不必看到此事，為我心憂。反而是輔公祏惡貫滿盈，必將死在為帝刀下，杯中血水也一定是輔公祏必亡徵兆。”
輔公祏聽聞李孝恭兵臨城下，自知如果不主動出擊，必然戰敗城失，便派遣馮惠亮邀戰。李孝恭穩坐不動，兩耳不聽反賊的言語，也壓住軍中因汙言穢語搖動的心。夜間，李孝恭讓李靖帶幾百精兵，劫持輔公祏的糧道。不出三日，輔公祏軍中糧食短缺，更是邀戰不斷，李孝恭笑臥床榻，按兵不動。
第五日，李孝恭佈局，先派能力不強的兵將打頭陣，輔公祏輕鬆擊潰，以為李孝恭也不過如此。不曾想後面竟有精兵強將緊隨其後，不一會兒，輔公祏的軍隊就四下逃散，退到梁山，李孝恭早就料到輔公祏有此一招，早派兵在梁山別鎮埋伏，徹底將敵人打得落花流水。
李孝恭驟然長逝
武德七年（624年），天空送來遲到的驚雷，輔公祏窮途末路，但還是未放下抵抗之心，準備放棄丹陽，到別處再謀起事。李孝恭立馬派出騎兵對輔公祏進行地毯式圍剿，終於在3月28日的丹陽一個不起眼的村落中，將其俘獲。二十九日，聖旨快馬送到，李孝恭拜揚州大都督，從此江南富庶一帶及嶺南地轄，都由他一手把控。
所謂功高震主，是禍非福也。李孝恭曾經也有過類似的疑心，但是自己本就流淌著李氏皇家血液，加上與皇帝一家關係親密，也就不再多做他想。只是李孝恭不知道他不想，不代表他人不眼紅他的威名權勢。李世民玄武門奪位不久，就有人參了李孝恭一本，說他有心謀反，李世民即刻派人將李孝恭軟禁。
然而，哪怕是地毯式排查，也找不出證據證明其謀反。李世民面帶歉意，赦免李孝恭為宗正卿，賜予一千二百戶。李孝恭經此一事，明白“伴君如伴虎”，自此以後開始在家散養上百歌女，每日都宴飲酒肉好友，逍遙快活。
李世民見李孝恭再不如殺伐陣陣的模樣，放下了心中的防備，李孝恭的“荒淫晚年”生活方式，救了他，也給自己的後代留下一條生路。貞觀十四年（640年），李孝恭突發腦溢血身亡，一代功臣就這樣長辭，李世民親自到靈前哭悼。
李孝恭是一個真正活得明白，活得通透的功臣，知道“君臣一夢，今古空名”的道理，也難怪李世民會將他排在凌煙閣功臣薄第二名的位置上！