滿清入關統一中原後，應該共同抗清的南明，一直處於無休止的內鬥之中。更要命的是，幾支強大的明軍各自擁戴不同的朱姓王爺，始終無法擰成一股繩，大大削弱了反清復明的力量。
最有實力的鄭成功，空有一支強大的水師，卻無力阻止清軍南下。為了建立更廣闊的根據地，鄭成功率軍收復臺灣，趕走荷蘭殖民者，使臺灣重新回到了祖國的懷抱。
在此之前，臺灣對明朝來說，只是一片化外之地。西班牙人和荷蘭人先後佔領這個大島的主要居住地。島上生活著大量的漢人移民和高山族土著，遭受著歐洲殖民者的殘酷統治。
滿清完成大陸上的統一後，便只剩下臺灣這個抗清基地。不過，清軍暫時無力攻取臺灣，因為他們不懂海戰。鄭成功的父親鄭芝龍，也曾經是一名海盜首領和水師統帥，雖然率軍投降了清朝，但清廷對他很不放心，不敢讓他去攻打兒子。
滿清對鄭成功政權進行多次招降，都沒有成功。只好實行嚴厲的禁海政策，企圖困死鄭成功。幾十年下來，禁海只是苦了沿海的百姓，至於收取臺灣，仍然遙遙無期。這個局面直到一個人的到來，才被打破。
這人是施琅，鄭氏集團的水師將領。滿清對施琅一點也不陌生，鄭芝龍降清時，施琅也在隊伍當中。可是，清軍那時候對水師不重視，對鄭芝龍的人也不信任。施琅再次投向南明的永曆朝廷，成為李成棟的部下。沒多久，李成棟把施琅送回到鄭成功的屬下。
這樣複雜的經歷，使施琅難以受到信任，雖然很有才幹，但再也得不到鄭成功的重用。後來，為了施琅擅殺曾德的事情，鄭成功將其全家逮捕。施琅逃出監禁，卻累及全家被殺。從此，施琅徹底倒向滿清。
第二次降清後，施琅先後被封為同安副將和總兵，提督福建水師，多次擊退鄭成功的進攻。施琅成為鄭氏集團最大的對手，隔海對峙數十年。
康熙登基時才8歲，等到剪除鰲拜、平定三藩之亂等一系列事件後，天下初步穩定。臺灣開始進入康熙的視線時，已經是1681年。而鄭氏集團的內訌，讓康熙看到了收復臺灣的機會。
鄭成功去世後，鄭氏集團已經出現過一次分裂。長子鄭經與鄭成功弟弟鄭襲，為了爭奪繼承權發生內鬥。清軍趁機攻佔廈門，使鄭軍失去了許多沿海的根據地。
施琅三次率水師想渡海進攻臺灣，都遭遇到颱風，沒有成功。康熙叫停施琅的計劃，把他留在京城隨時聽用，等待收復臺灣的命令，這一等就是十三年。
1681年，鄭經病逝。在繼承人的問題上，又一次掀起大亂。長子鄭克臧是當之無愧的接班人，但次子鄭克塽的岳父馮錫範，毒死鄭克臧，扶植12歲的鄭克塽上臺。忠於鄭克臧的力量遭到清洗，政局出現動盪，人心思異。康熙意識到自己的機會來了。
1682年，清廷重新起用施琅，復任福建水師提督，負責指揮收復臺灣的水陸人馬。一開始，康熙還讓姚啟聖與施琅共同指揮，意識到施琅才是真正合適的將領後，康熙將全部指揮權交給了施琅。
經過一年多的準備，施琅摩下已經擁有238艘戰船，24000名士兵，具備了與鄭氏集團決戰的能力。1683年6月14日，施琅率船隊從銅山出發，首要目標是澎湖以南的八罩島。
鄭軍方面的主帥是劉國軒，是鄭成功手下的老將，參加過反攻南京、收復臺灣等戰鬥。鄭克塽上臺後，劉國軒掌握了鄭氏集團的軍權。確定了清軍準備攻臺，劉國軒親自坐陣澎湖，迎戰施琅。
7月16日，施琅進攻娘媽宮。劉國軒指揮水軍奮力戰鬥，粉碎了施琅的企圖。雙方互有傷亡，施琅還受了傷，但沒有大礙，不影響繼續指揮。
次日，劉國軒攻擊施琅的根據地八罩島，不但沒有成功，反而被施琅趁虛而入，奪取了澎湖外圍的光井嶼和桶盤嶼。施琅對臺澎地區瞭如指掌，總能打擊到對方的兵力薄弱處，掌握了戰場的主動權。
22日，施琅發動總攻，156條戰船分三路夾攻澎湖主島，他自己率中路主攻，左路負責吸引敵軍注意力。劉國軒出動全部兵力進行抵抗，鄭軍船隻的總數並不少，但船的堅固程度較差，火器也不及清軍，在對戰中很是吃虧。
戰鬥從早上打到中午，海面上颳起南風。清軍正處在上風位置，帆船吃滿風，速度加快，武器射程也增大不少。施琅乘此良機，把後備的80艘戰船也加入戰場，取得了數量優勢，以五船圍攻鄭軍一船。
經過一整天的激戰，鄭軍水師徹底
大敗
，幾位主要將領陣亡後，鄭軍掛白旗投降。清軍只付出陣亡329人，受傷1800多人的代價，一船未失，便消滅敵軍12000人，生俘5000人，摧毀和繳獲190多艘戰船，鄭軍水師主力基本覆滅。劉國軒無心再戰，逃回臺灣。
施琅苦心經營和訓練的水師，終於取得了決定性的勝利。他表現出來的海戰指揮能力也優於劉國軒等人。60多歲的施琅親自站在船頭指揮作戰，也比劉國軒在岸上遙控，更能鼓舞全軍計程車氣。
澎湖一戰後，鄭氏集團原本脆弱的政權進一步分化，人心惶惶，許多將領開始暗通施琅，或想投降、或想逃往海外，沒有人願意為鄭克塽和馮錫範而戰。
等到鄭氏集團分崩離析後，施琅才在臺灣登陸。兩天後的7月15日，鄭克塽宣佈投降，鄭氏集團正式滅亡，臺灣重新回到中原王朝的版圖。從施琅進軍，到鄭氏投降，只有一個月時間，真正交戰不過8天。
鄭氏集團的覆滅如此之快，出乎很多人的意料。除了施琅熟悉內情，精通海戰，併為此戰謀劃了幾十年外，鄭氏自身的原因也佔有很大因素。
充滿陰謀的繼承過程，以及集團上下早已沒有了當初復明的雄心，所有人都只想保住自己的性命和富貴而已。當澎湖天險喪失，大家都認清統一大勢不可逆轉後，不戰而降便成為理所當然的選擇。
【參考資料：《清聖祖實錄》、《海紀輯要》等】