多名國防部官員透露，美國最高軍事將領、參謀長聯席會議主席陸軍上將馬克·米利聯絡了他的幾位"朋友"，討論了可能辭職的問題。在6月4日，馬克·米利在給美軍幾大部門最高將領和各級軍官的備忘錄中提及了美國憲法，米利表示，美國軍隊由各個種族，膚色和信條的人組成，這體現了美國憲法的價值觀，為此他還特意在備忘錄上手寫了一句話："我們所有人都應忠於這一誓言，忠於美國人民"。
此後，這些美國將領紛紛表態。美國海軍部長吉爾迪上將也在家中錄製了一段五分鐘的影片，表達了對種族歧視的憤怒，並對其他少數族裔軍人表達了自己的慰問。美國軍方的態度與總統特朗普是完全相反的，這也是因為特朗普是為美國精英階層考慮的，而五角大樓則有很多的有色人種將領和黑人將領，因此在某種事情處理上會更加的小心謹慎。前段時間，部分抗議人群將西雅圖市的警察局佔領，並且劃分了6個街區表示成立所謂的"國會山自治區"。
得知這一訊息後的特朗普極為憤怒，連發幾條推特怒懟這些人，並揚言要派出國民警衛隊進行暴力鎮壓。但西雅圖市市長卻表示，西雅圖市不會接受軍隊對這些抗議者進行驅逐，因為這樣做是違背美國憲法的。根據美國憲法規定，美國公民是享有抗議示威的權利的，只要不是某種程度上的暴亂都可以被接受。這次因為黑人被虐殺而引發的抗議活動愈演愈烈，州政府很難平息民眾的怒火，而特朗普又火上澆油，挑起事端來，一時間地方政府與聯邦政府之間的矛盾進一步加大。
與此同時，五角大樓的軍方高層也和特朗普心生嫌隙。根據美國媒體報道顯示，美軍參謀長聯席會議主席、四星上將馬克·米利已經就此前陪特朗普前往教堂拍照一事進行道歉。在6月1日下午的時候，身穿軍服的馬克·米利與特朗普一起步行透過拉斐特公園前往聖約翰聖公會教堂。但在前往教堂的途中，有一群抗議者卻突然圍堵了上來，為了確保總統和參謀長的安全，警方用暴力驅散了在拉斐特公園裡的抗議者。
這引發外界不小爭議。有不少人認為美國警察的行為根本就是對如今因為種族歧視引發抗議活動的淡漠處理，而五角大樓和白宮根本就不理會人民的訴求。面對外界的指責，馬克·米利只得釋出了一份道歉影片，就關於軍隊介入政治一事進行解釋，馬克·米利遺憾的表示和特朗普前往教堂是一個錯誤，稱自己的行為破壞了軍隊不干預政治的承諾。