11月5日，國臺辦發言人朱鳳蓮在記者會上直言點名臺行政機構負責人蘇貞昌、臺立法機構負責人游錫堃、臺外事部門負責人吳釗燮，並將此3人列為“臺獨頑固分子”。朱鳳蓮表示，大陸方面依法對清單在列的上述“臺獨”頑固分子實施懲戒，禁止其本人及家屬進入大陸和香港、澳門特別行政區，限制其關聯機構與大陸有關組織、個人進行合作，絕不允許其關聯企業和金主在大陸謀利，以及採取其它必要的懲戒措施。同時，朱鳳蓮強調，我們正告此類“臺獨”頑固分子，凡是數典忘祖、背叛祖國、分裂國家的人，從來沒有好下場，必將遭到人民的唾棄和歷史的審判。大陸方面將依法對“臺獨”頑固分子追究刑事責任，終身有效。然而，在大陸出手制裁後，上述“臺獨”頑固分子還得意洋洋，對此，島內媒體馬上潑了一盆冷水。
據環球網11月10日報道，在登上“臺獨頑固分子名單”後，游錫堃自稱“引以為榮”，蘇貞昌則立即揚言“不受威脅”，而吳釗燮則說，“很多人因為未上榜而感到嫉妒”。另一批沒啥政治份量的“臺獨”分子也叫囂著極端言論，想被列榜上。對此，臺媒8日訊息稱，民進黨前民意代表郭正亮表示，上榜的臺灣官員級別非常高，代表很大的警告，表明兩岸關係已經相當危急。郭正亮認為，目前列出這份名單就是一個殺雞儆猴的態度，而且絕非只是點名，因為制裁還包括與這些人有互動的機構，而且是終身究責，可能不是玩假的。
郭正亮還指出，那些要在臺灣參加選舉的人，至少金主會不敢接他們的電話，這必然會有寒蟬效應。雖然這些人未來不會因此就募不到錢，他們也可以去找和中國大陸沒有關係的本土企業，但那樣一來，政治獻金的規模就非常少。
另有臺媒援引島內媒體人吳子嘉的觀點認為，國臺辦針對蘇貞昌的部分，最具殺傷力就是修理臺商跟金主。今年蘇貞昌慘了，明年是議員選舉，蘇系議員大概有十幾個，很多大咖的臺商都不敢接蘇貞昌電話。另外，蘇貞昌的女兒、民意代表蘇巧慧的政治獻金，排名前十的有幾家在中國大陸都有業務，這些都是可以查得到的公開資料。
對於此類觀點，福建閩南師範大學“兩岸一家親”研究院名譽院長王建民也曾指出，一些“臺獨”分子在政治參與過程中會秘密受到各種金主的支援，有些金主確實是在大陸經商。現在來自大陸的警告非常嚴重，威懾力是非常大的，甚至可能會影響到島內的政治生態、改變島內的政治格局，影響島內民眾對兩岸關係的判斷，“相信今後，在大陸賺錢的臺商將不敢再去支援‘臺獨’。”
此外，臺灣著名時事評論員邱毅也認為，國臺辦此次出臺懲罰措施很好，絕對能起到反“獨”促統的作用，可以說是對“臺獨”的當頭棒喝，可以讓“臺獨”分子知道，不是在統一之後才沒有好下場，而是在統一之前就必須為自己的“臺獨”行徑付出重大代價。