虹口海關管轄區域為上海市虹口區，承擔虹口區範圍內進出境貨物申報、進出境企業註冊備案、減免稅監管、加工貿易監管、檢驗檢疫等屬地業務工作；承擔上海港進出境船舶及其供應物料監管、船舶服務企業管理、進出口大宗散貨重量鑑定、進出口危險化學品及其包裝檢驗、植物檢疫等上海關區專業性指定業務；承擔上海關區進出境船舶艙單電子資料的管理，船舶供應保稅倉庫、免稅品監管倉庫及其所存貨物的監管，境外船舶修理監管等職責；承擔上海關區加工貿易備案業務和稅收後續跟蹤清算業務。
綜合業務科
承擔虹口關區（關區程式碼2243）進出境貨物的通關業務，落實關稅政策，徵收關稅及其他稅、費；承擔轄區內（關區程式碼2243）企業的加工貿易手冊、賬冊設立、變更及核銷業務；承擔轄區內保稅監管場所及經營人的監管工作；承擔轄區內保稅監管場所設立申請的受理、初審和上報工作；承擔非交通工具類檢驗檢疫證書的繕制和簽發；配合承擔屬地納稅人管理工作。
上海市虹口區楊樹浦路18號8樓7號、8號視窗
諮詢電話：68891000*605397
企業管理科
承擔轄區內（關區程式碼：2243）報關單位註冊登記、特定資質企業備案及跨境電商出口海外倉模式備案；承擔關區內企業日常信用管理、信用培育等工作。
上海市虹口區楊樹浦路18號801室
諮詢電話：60157083
稽查科
承擔轄區內企業常規稽查、核查，緝私線索受理及兩簡案件辦理。
上海市虹口區楊樹浦路18號808室
諮詢電話：68891000-605348
查檢一科
承擔轄區內外來有害生物監測工作；承擔轄區內出入境特殊物品的檢疫查驗、後續監管工作。
上海市虹口區江楊南路9號311室
諮詢電話：60157044
查檢三科
承擔轄區出入境植物及其產品和其他應檢物的檢驗檢疫和監督管理，實施境內外植物疫情、有毒有害物質監測和重大疫情的緊急預防控制措施；承擔出口植物及其產品和其他應檢物的生產、加工和存放單位的註冊登記備案的受理和日常監督管理，實施出入境動植物檢疫除害處理的監督管理工作。
上海市虹口區江楊南路9號304室
諮詢電話：60157047
查檢四科
承擔上海口岸進境大輪散裝動植物油以及大宗散裝糧谷的重量鑑定工作；承擔上海海關（除洋山、金山地區、上海化工園區外）進口船運大宗散裝商品，主要包括石油及其石油產品、礦產品、煤炭、化工品等商品的重量鑑定工作；承擔部分指定地區的進出口大宗散裝商品的重量鑑定工作；承擔相關的委託檢驗鑑定工作；承擔負責所轄商品的檢驗檢疫情況、資訊、檢驗標準的收集工作，負責相關商品的質量分析、檔案管理工作。
上海市虹口區江楊南路9號409室
諮詢電話：60157054
查檢五科
承擔進口大輪散裝成品油、動植物油、化工、橡膠製品；進口散裝、集裝箱裝礦產品、其它非危化工品（原浦江檢驗檢疫局所轄區域除嘉定外）、玻璃幕牆用矽酮密封膠的檢驗監管工作。
上海市虹口區江楊南路9號205室
諮詢電話：60157063；60157065
查檢六科
承擔轄區內出口危險貨物包裝效能檢驗及使用鑑定工作。
上海市虹口區江楊南路9號204室
諮詢電話：60157073，60157074
查檢七科
承擔進出上海港（除洋山港、金山地區和崇明地區以外）國際航行船舶供船物資的查驗工作；承擔上海關區境外船舶修理物資的查驗工作；承擔轄區進出口商品的法定檢驗；承擔轄區內進出口食品、化妝品的檢驗。
上海市虹口區江楊南路9號302室
諮詢電話：60157079
船舶監管一科
承擔進出上海港（除洋山港、金山地區和崇明地區以外）國際航行船舶、國際國內兼營船舶、沿海和長江內支線承載海關監管貨物的船舶的實際監管；承擔對經風險判定無需登輪檢疫的船舶，稽核船方提供的入出境檢驗檢疫申報資料後，簽發船舶入出境衛生證書；承擔對其他稅（船舶噸稅）的徵收及噸稅執照的簽發；承擔經營國際航行船舶及其代理、兼營船舶、沿海和長江內支線承運海關監管貨物的船舶的日常管理。
上海市虹口區楊樹浦路18號8樓北大廳
諮詢電話:65461834
船舶監管二科
承擔上海關區進出境船舶艙單及相關電子資料的管理工作；承擔進出上海港國際航行船舶供船物資的通關管理工作；承擔經營國際航行船舶及其代理及供船企業的備案管理；承擔船舶供應保稅倉庫（除吳淞口國際郵輪港專用型保稅倉庫以外）、免稅品監管倉庫及其所存貨物的通關管理工作；承擔船舶供應保稅倉庫（除吳淞口國際郵輪港專用型保稅倉庫以外）設立申請的受理、初審和上報工作；承擔上海關區境外船舶修理的通關管理工作。
上海市虹口區楊樹浦路18號8樓南大廳
諮詢電話：35365061
供稿單位：虹口海關