除了感染特定型別的腸病毒(例如腸病毒71型)外，發展成為嚴重腸病毒的因素，亦與病毒的數量、受感染者的年齡、性別及自身的免疫能力密切相關，因此，知道如何觀察嚴重的症狀，可使受感染者及時接受治療，遠離更大的危害。
不同型別的腸病毒會引起不同的症狀，同一型別的腸病毒在不同的人身上可能會有不同的症狀，多達一半的照顧者不知道孩子是誰或在哪裡感染的，主要是因為腸道病毒的強烈傳播，感染後可能不一定有典型的疾病，可能只有輕微的發燒、喉嚨痛或其他類似感冒的症狀，甚至有些成年人也沒有感染病毒的症狀，因為他們有良好的抵抗力。
大多數典型的腸道病毒疾病是手足口病和皰疹性咽炎，詳細描述如下：
手足口病
症狀是發燒，身體出現小皮疹，有些皮疹可能有小水泡，更有可能發生在手掌、腳底、手指、腳趾、膝蓋和其他關節。
皰疹性咽炎
症狀為咽部峽部發燒、水泡或潰瘍，導致流口水或進食疼痛。
傳染性腸病毒高達90%以上的輕度疾病，只有少數兒童會變得嚴重，換句話說，沒有必要過度緊張，目前治療腸道病毒更多的支援性藥物來緩解症狀引起的不適，大多數兒童如果沒有其他嚴重的前兆，大部分可以在一週左右治癒。
孩子越小，越有可能出現其他症狀，因為孩子的免疫功能很弱，加上許多嬰兒的器官功能會在出生後逐漸成熟，較難抵禦病毒攻擊，更有可能導致其他併發症，如腦膜炎、腦膜炎、心肌炎等。
如果腸病毒不是輕微感染，感染後3或5天內就會出現大部分嚴重的前驅物，只有一個嚴重的前驅物可能會出現，或可能同時出現。有關的指示如下：
一、持續高燒&反覆發熱：通常當身體發炎或免疫系統與病毒競爭時，會引起發熱反應。同樣，發燒也是腸道病毒感染後常見的症狀，但如果持續高燒或反覆發熱，則需到醫院進一步檢查或治療。
2.肌肉抽搐：肌肉跳躍抽搐多發生在孩子睡著時，照顧者可以清楚地發現，孩子在睡覺時，突然像害怕一樣產生大動作痙攣，有的孩子可能因此害怕醒來。
3.持續嘔吐：嘔吐的可能原因很多。如果兒童出現不明原因的嘔吐，可表現為腦發炎、腦壓過大等。此時還需進一步檢查和治療。
4.手腳虛弱及嗜睡：由於腸病毒感染可能影響大腦和脊髓，少數兒童會出現手腳虛弱或昏睡，還可能影響心肺功能、心跳加快、呼吸急促、手腳冷、冷汗等症狀。
感染腸病毒的首1/2天可能沒有典型症狀，但如果上述四種嚴重前兆稍後出現，重要的是要保持警惕，及時送去治療。
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