核磁共振儀的危險並不在於其本身，而是在於強大磁場，對周圍物體的吸引，造成的附帶傷害。自從1944年前蘇聯發明核磁共振儀以來，由核磁共振儀引起的醫療事故，層出不窮，上述兩例僅是見於公開報道中的個別案例。
人體裡含有大量水分，一個水分子由一個氧原子和2個氫原子組成。
氫原子的原子核是一個質子。根據量子力學，質子帶一個正電荷，而且還有自旋和角動量。一個帶電的旋轉的粒子，必然產生磁場。量子力學用來描述這種微觀粒子磁場的專業術語叫做磁矩。
眾所周知，兩塊磁鐵是會相互吸引的。核磁共振儀就是這樣一個大磁鐵。在這個大磁鐵形成的磁場裡，只要磁場超過一定的強度，人體內的氫原子核，會朝向一個方向偏轉一個角度，形成整齊排列的陣列。
然後，核磁共振儀，朝這個氫原子陣列發出400兆赫茲的電磁波。這個電磁波大概在我們手機2g頻率的範圍內。但是它的強度很弱，所以一般對人體沒有損害。
氫原子核陣列的質子，吸收了電磁波以後，就會處於激發態。這個電磁波消失以後，氫原子會從激發態跳回原來的狀態（在量子力學裡面，這種回跳的狀態有專門術語，叫做遷躍），這個時候，每個氫原子核會發出方向性高度一致的電磁波。
病人在做核磁共振儀的時候，聽到的嗡嗡聲，是高頻電流切換髮出的聲音和其他機械的噪聲。
因為核磁共振儀的磁場強度非常高，它的開機勵磁過程也很長。所以，做核磁共振之前，要等待一段時間。即使把核磁共振已完全關掉，它的磁性褪去也要有七八個小時。
醫用核磁共振儀的磁場強度，一般在0.5特斯拉到2特斯拉之間。0.75特斯拉的核磁共振儀對一公斤的鐵塊可以產生強達300公斤的吸引力。所以在核磁共振儀旁邊使用鐵製器具是致命的。
下面這個影片，是美國遊手好閒人士，用淘汰的核磁共振儀，測試磁場強度的實驗。試驗中顯示，一個金屬質的轉椅，被磁場吸引時產生了1.2噸的拉力。