本賽季的上半程，拜仁表現得相當掙扎，這跟主教練科瓦奇的戰術不當有很大的關係。而穆勒在科瓦奇的戰術下完全沒有位置，漸漸的穆勒失去了主力位置，還曾一度被按在替補席上連續6場替補。科瓦奇對穆勒這樣的使用，讓球迷非常不滿，而穆勒本人也是鬱郁不得志。最終拜仁在客場1-5慘敗給法蘭克福後，宣佈由弗裡克接替科瓦奇擔任主教練。最後在弗裡克的悉心指導下，穆勒又回到了熟悉的位置，繼續擔任球隊的主力，結果，穆勒迎來了大爆發，25輪過後打進6個進球和16次助攻。用出色的表現來回報弗裡克的信任，重新證明了自己依然是拜仁的傳奇，依然是那個“二娃”。
本賽季的德甲，從戰術層面上，作為“空間閱讀者”的穆勒可以透過自己靈活的跑位為身前的萊萬創造更多的空間，另外，穆勒也可以適時在兩個邊路活動，起到串聯前場攻擊組合的作用。雖然穆勒在科瓦奇手下沒能得到太多的出場時間，但弗裡克上任後，穆勒迎來了職業生涯的第二春。在14場比賽中創造16球，場均1.14球，同是他還以16次助攻成為德甲目前為止的助攻王。
那麼穆勒為何能躍居成為助攻王呢？究其原因主要是因為穆勒在球場上的位置多變，準確的預判，靈活的跑位讓他總是能夠出現在合適的位置，為隊友創造出射門的機會。更重要的是穆勒甘心當綠葉，他喜歡“刷助攻”，透過拜仁的前25場比賽，穆勒有5場比賽助攻都達到了兩個，甚至在強敵多特蒙德的身上都助攻雙響，由此可見，穆勒的球商真的很高。