所谓重点大学即重点建设高校，有全国重点高校和省属重点高校之别，一般而言，我认为泛指中央部属和省属的“211工程”重点建设高校（全国116所）。
所谓一本院校和二本院校是根据高招录取先后顺序划分的，重点高校都在本科一批次招录，也就是说重点大学一定是一本院校，而并不是所有的一本院校都是重点大学。
三者主要区别：
一是录取分数不同。重点大学在各省录取分数线一般远远高于其他一本院校，一本院校录取分数线远远高于二本院校录取分数，比如2018年吉林省理科一本线533分，二本线405分，三本线283分。
二是专业学费不同。一般而言，二本院校（特别是民办、独立学院）院校的专业学费较高，是公办院校的3～4倍，重点大学大都由国家财政支持，学费相对较低。
三是师资力量不同。重点大学汇聚了全国一流的师资力量，名师大咖云集，两院院士众多，远远好于其他一本院校，二本院校更是相差甚远。
重点大学和一些比较好的一本大学都是很早建起来的，经历过战火，经历过革命，它们本身就是历史的见证，有着深厚的历史底蕴。而且这些大学往往名师荟萃。鲁迅曾在北大任教，季羡林曾在北大任教，朱自清曾在清华任教，钱玄同曾在北京师范大学任教，这样的历史底蕴和师资力量是小学校没法比的。
优秀的教师会吸引优秀的学生，优秀人才汇集的地方会不断吸引更优秀的人才。人才汇聚的地方，那里的环境、那里的独有氛围带给学生的开阔的眼界和进步的思想、那里能给学生提供的平台和机会都比二本学校更好、更广阔。
重点大学和好的一本大学的优点，二本比之它们自然是差了很多，但也有其存在的意义。二本学校也在努力为学生提供更好的环境，努力提高自己的教学品质，但是它们建得晚，而且也没有国家重点扶持，所以肯定很多地方比不上重点和一本。这也就是比上不足比下有余。
不过二本学校有一个最大的槽点就是真的很形式主义。修的新楼可能就是应付检查从来没见用过，宿舍卫生比作业都查得严，学生像是去学后勤专业的。