其实在历史上，文莱也曾经是东南亚最强大的国家，其疆域包括今天菲律宾南部，以及砂拉越和沙巴，整个加里曼丹岛几乎都是文莱的领地，面积相当于现在的几十倍还要多。
可是，究竟经历了什么，让文莱失去97%的领土面积，仅有的一点地盘，还被马来西亚横腰拦断呢？
一、曾经的东南亚大国。
和马来西亚、印尼这些年轻国家相比，文莱的历史可谓是相当悠久。根据考古发掘，早在一万多年前，文莱就有人类活动的踪迹。其文化经历过石器、铜器和铁器时代。
公元4世纪左右，文莱地区出现了摩拉拔摩王国。六世纪时，该国就曾派使者渡海来到中国。到了唐朝中叶，室利佛逝帝国占领了文莱，和中国的交流更加频繁。后来，爪哇岛的满者伯夷王朝成为南洋群岛上最后一个强大帝国，曾经长期统治文莱。
从14世纪到16世纪，文莱苏丹国迎来了它的辉煌时代。特别是第五代文莱苏丹博尔基亚统治时期，文莱帝国控制了婆罗洲西北部及苏禄群岛、棉兰老岛的部分地区。到了16世纪，其影响力延伸至婆罗洲西部的卡普阿斯河三角洲。
元末明初，文莱渤泥王国走向衰落。南边的印尼，东边的苏?国不断袭扰。后来福建人黄森屏华人势力与渤泥国苏丹马合谟沙联合建立文莱国，共同抵御外敌。
二、西方列强的入侵。
大航海时代开启后，交通便利，资源丰富的文莱，成为欧洲列强竞相入侵的对象。葡萄牙捷足先登，于1536年袭击摩鹿加穆斯林，双方爆发冲突，葡萄牙驻文莱大使不得不选择离开。
相比之下，西班牙人和文莱的关系更加紧张。自1565年起，西班牙海军和文莱军队之间，就常常发生小规模的军事冲突。到了1571年，西班牙人成功占领马尼拉，文莱曾派军队收复失地，但未能如愿。
三、沙巴和砂拉越的丢失。
随着西方殖民者不断对文莱领土的蚕食，曾经辉煌的文莱帝国日渐没落，如今占马来西亚大部领土的沙巴和砂拉越两个地区，也先后失去控制。
沙巴旧称北婆罗洲，位于婆罗洲岛北部，面积76115平方公里，海岸线长达1440公里。
1846年，文莱苏丹将北婆西海岸的纳闽岛割让给英国。到1888年时，整个北婆罗洲成为英国的殖民地。
1963年8月31日，北婆罗洲获得自治地位，但仍未独立。其国防、外交、财政等事务均由英国政府掌控，直到1个月后，马来西亚成立，北婆罗洲更名为沙巴，并入马来西亚，英国总督才正式移交权力离开。
砂拉越是加里曼丹岛上最大的州，面积近124450平方公里，占马来西亚总面积的37.5%。其南与印尼加里曼丹接壤，并将文莱隔成两部分。
早在19世纪初时，砂拉越地区的伊班族、卡扬族和肯雅族相互间通过部落战争，争夺地盘，文莱苏丹逐渐失去对砂拉越内陆的控制。
古晋地区发现锑矿后，文莱苏丹的派驻代表班根丁·马哥达，负责当地的管理。随着税收的不断增加，砂拉越人的反抗愈加激烈。1839年，文莱苏丹奥马尔·阿里·赛义夫丁二世指派班根丁·木达.哈新派兵镇压，并请求前来砂拉越的英国探险家詹姆斯·布鲁克，协助平息暴动。
作为回报，木达·哈斯任布鲁克为砂拉越州长。1843年，布鲁克的军队击败了木达·哈斯在砂拉越的驻军，木达·哈斯死后，布鲁克成为砂拉越唯一统治者，建立起白人拉惹王朝。
布鲁克野心勃勃，向英国方面征询，能否将文莱最后的领土吞并，控制整个文莱。但英国方面告诉他，尽管文莱国土尽失，但仍然是一个主权国家，不能就此吞并。
于是布鲁克不断向沿岸推进，1861年，文莱割让民都鲁给布鲁克，1885年，布鲁克家族又购入林梦一带的土地，将其纳入砂拉越的版图。日渐强大的砂拉越，已经成为美国和英国承认的独立国家。
二战结束后，砂拉越成为英国直辖殖民地。1963年，在加入马来西亚的前提下，砂拉越随着马来西亚的独立，正式成为马来西亚的一部分。
原本大部地区属于文莱的马来西亚，独立之后向文莱表示了非常强的合并意愿。当时的文莱王室也同意了，但在利益分配上一直谈不拢，最后只能不了了之。
（参考资料：《文莱和马来西亚争端的起源与发展》等）