说到藏南不得不说的一个事情,当年英国侵略印度到达西藏的边界。一名英国外交官亨利·麦克马洪，因为他主持了1914年讨论此边界的西姆拉会议。其走向起自不丹和西藏交界处，大致沿分水岭和山脊线至云南独龙江东南的伊素拉希山口，将传统上被认为属于西藏的约9万平方公里领土非法划给印度和缅甸。这就是臭名昭著的麦克马洪线。
麦克马洪线并不是一条画在分水岭上的边界线，全线有7处被河流穿越，给中国与印度、中国与缅甸的关系留下后患，由于各自国家对麦克马洪线的不同理解，造成了冲突，例如中缅之间产生独龙江归属之争，中印之间产生克节朗河流域归属之争，以及中印缅三国交界是位于底福山口，还是塔庐山口之争。但中国历届政府都不承认其国际法效力。
我国政府一直拒绝承认麦克马洪线，自古以来藏南属于西藏是中国不可分割的一部分要求印度巡逻队不可越过，为了缓解边境冲突我国巡逻队也不越过。中印两国自1962年战后的一系列争端，都是印度对边境挑衅有关，因为印度越过边界我方自卫反击。结果由于这条边界引致1962年的中印边界战争，中国决心出兵教训一下印度，印度虽得到美国及苏联的支持，仍然战败。中国虽然在战争中胜出，我国也平着边境友好不希望战争，表示可以同印度开展互惠互利边界谈判，山峰的连线作为勘界标准。但由于印度认定麦克马洪线就是申索藏南地区的合法依据，因此再度非法占领藏南。使印度得以继续控制麦克马洪线以南的地区。
1987年印度国会通过法令，非法将麦克马洪线以南的中印争议地区（我国的藏南）和印缅边界一些地区合并建立阿鲁纳恰尔邦，中印争议地区的面积占该邦总面积的80％。目前，印度已有30万的移民屯居在这个争议的边境上。中国以后如果再提出边界问题，如何处理这些移民将有颇大困难。
麦克马洪线经过许多高寒、偏僻地带，这些地方还都没有驻军，但还是派遣巡逻队定期交替巡逻。在一些巡逻到的过渡地带，我方军队都会留下标记以宣示主权。但由修路或军队巡逻而引起的边境对峙和冲突也时有发生。