作为咖啡的重要成分之一，咖啡因是种白色晶体化合物, 还存在于可可、茶叶中。饮用咖啡后，咖啡因可以在5分钟内到达体内各个组织。《新英格兰医学杂志》刊文总结了咖啡、咖啡因与健康的关系，提示咖啡对身体各器官功能的影响。
大脑
可减轻疲乏、消除困倦，使大脑保持较高的警觉状态，表现为精神兴奋、思维活跃。
胃
刺激胃酸分泌，促进消化。
肠道
促进肠道蠕动、有助排便。
心脏
短时间内可能提高血压，但将量控制在每天1~2杯，不会增加心血管疾病风险。
肾脏
有利尿作用，可以消除水肿。
肺
可能改善肺功能。
生殖系统
过量咖啡可能增加孕妇自然流产风险。
对于咖啡饮用量，目前营养学界和医学界广为接受的推荐是：健康成年人每天喝两三杯，益处超过风险。