蚂蚁集团财报显示，2017年、2018年、2019年以及2020年1-6月，公司向阿里巴巴集团收取的支付处理和担保交易服务费金额分别为56.30亿元、75.66亿元、92.36亿元以及40.44亿元，而同期蚂蚁集团数字支付与商家服务收入分别为358.90亿元、443.61亿元、519.05亿元以及260.11亿元，占比分别为15.7%、17.1%、17.8%和15.5%。
根据蚂蚁集团透露，阿里巴巴集团根据费率及阿里巴巴集团的交易市场上实际处理的支付额向支付宝及发行人的其他子公司支付费用。关于费率，蚂蚁集团称，对于市场上的客户，一般会综合考虑服务对象的业务体量、交易规模、市场竞争状况、对于支付宝生态体系的价值和重要性、合作深度等因素，在商业谈判的基础上与重要客户合理协商确定支付费率水平。
而对于阿里巴巴，决定费率有三个因素：：一是支付宝向阿里巴巴集团提供服务而产生的银行处理成本及支付宝运营费用；二是其他服务主体提供类似服务的市场价格；三是支付宝向第三方客户提供服务的价格以及提供给重要客户的折扣，并依据上述相关费用的增减，进行年度调整。