吕文君在上海上港属于功勋球员，他为球队立下过赫赫战功。徐根宝在执教上海东亚时，就开始重用吕文君。在徐根宝眼中，吕文君是个不可多得的帅才，所以一直对他器重有加。吕文君是一个多面手，可以踢前腰和边前卫，有时候还会根据球队需要客串踢中锋。吕文君踢中锋很有特点，号称崇明岛德罗巴。凭借着在上海东亚的出色表现，吕文君入选了国奥队并成为了核心。吕文君在国奥队是定位球主罚者，所以他经常上演任意球破门的好戏。
吕文君在上海东亚的地位跟武磊是一样的，都是球队不可或缺的主力。吕文君之所以深受主帅徐根宝的器重，主要有两个原因。第一个原因是在徐根宝最困难的时候，吕文君选择跟球队共患难。当时徐根宝一个人支撑起上海东亚队的运营，显得有些力不从心。所以上海东亚就遇到了财政问题，徐根宝连工资都发不起。
在这种情况下，徐根宝并没有选择隐瞒，而是尊重球员的意见。徐根宝给以吕文君为首的球员开会，表示他们当中要是有人想走，自己绝不会拦着。如果球员觉得不好意思当面跟他说，可以发邮件说。随后吕文君给徐根宝发了一个邮件，非常肯定地表示希望自己能继续留在球队效力。至于工资徐根宝看着给就行，这让徐根宝非常感动。
吕文君受到徐根宝器重的第二个原因，是他从小就跟着徐根宝学踢球。徐根宝在崇明岛十年磨一剑，培养出了像武磊和吕文君这样的佼佼者。吕文君在上海东亚队刚刚崭露头角时，职业生涯前景要好于武磊。因为吕文君在89国奥踢主力时，武磊还没有在国字号球队站稳脚跟。
两人真正拉开距离，就是在上海东亚升入中超后，武磊开启了连续进球的模式，成为了多届本土射手王。后来武磊就在中超大红大紫，而吕文君只能充当绿叶。后来武磊离开上海上港加盟西班牙人，吕文君就成为了上港锋线新一哥。上赛季吕文君表现不俗，多次在比赛中进球，赢得了很多球迷的认可。本赛季吕文君受到续约风波的影响，没有发挥出自己应有的水准。希望吕文君能早日调整好状态，下赛季上演王者归来的好戏。