公元1219年，圍攻金朝的蒙古軍隊突然掉頭向西，發動了對花剌子模的戰爭。眼看金朝氣數已盡，滅亡金朝指日可待，蒙古大軍突然放棄圍攻金朝撤軍向西。這究竟是為什麼呢？原來，成吉思汗統一蒙古各部落之後，便產生了想與西方進行貿易的想法。因為自身是遊牧民族，不像宋朝那樣的的農耕民族一樣能夠自給自足，因此與遙遠的西方展開貿易迫在眉睫。在發動滅亡金朝的戰爭之前，成吉思汗就向西域派出了一條貿易的隊伍，這條隊伍由500人組成，起初是想先在花剌子模進行貿易，然後再沿着古代中原人開拓的絲綢之路向西前進。
但是想法很豐滿，現實卻很骨感。原來花剌子模的戍邊軍隊一口咬定這支貿易隊伍是蒙古人派來的間諜軍隊，於是上報了這個情況。花剌子模命令先行抓捕蒙古貿易隊的全部成員，但是戍邊軍隊並沒有把他們抓進大牢，而是就地將他們格殺。貿易隊全員慘死的消息最終傳進了成吉思汗的耳朵裏，此時成吉思汗正專注於對金用兵，因此決定將此事低調處理。後來只是派出使臣團前去要個説法，但是誰知道花剌子模毫不講理，小國花剌子模斬殺一使臣，並且“將餘使剃鬍還蒙古”。而這一做法徹底激怒了成吉思汗，他認為這是對蒙古的奇恥大辱，因此成吉思汗暫行擱置了對金用兵。
他下令軍隊向西翻越了阿爾泰山，一度抵達了石河，並且修建了諸多道路和橋樑，以期一舉滅亡花剌子模。在萬事俱備之後，成吉思汗為了滅亡這個不知天高地厚的國家，進行了周密的部署。成吉思汗兵分四路滅亡它，一路由兒子窩闊台與察合台率領，讓他們包圍敵軍重鎮訛答剌；一路由朮赤統領，讓其攻打氈的、養吉幹以及周圍城池；另一路由塔孩率領，討伐忽氈等城；最後鐵木真和拖雷親率中軍直接攻取布哈拉城。戰爭進行了將近一年，一年之後，包括穆斯林文化的核心城市布哈拉城在內的，錫爾河沿岸的大小城池悉數被蒙軍佔領。
春天過後，四支大軍合圍撒馬爾罕城，對此城進行了長達一週的圍攻。摩柯末蘇丹，也就是花剌子模最高首領在全軍覆沒之際帶着阿勒巴兒汗急忙出逃，而成吉思汗聽到後，派哲別圍追堵截，最後逼得摩柯末在一座小島死去。自此，成吉思汗命令全軍乘勝追擊，希望一舉滅亡這個帝國。後來他的兒子窩闊台“以五萬兵殲之者十餘萬人烏爾根奇”，也因此，整個河中地區被蒙古吞併殆盡，最終被納入蒙古帝國。而就是這樣一場復仇戰爭，使唐末以來就斷絕的東西方貿易得以再次繼續，而這也為後來蒙古大軍的西征奠定了基礎。