民俗是什麼
先舉幾個具體的例子。
中國民俗現象的例子：包餃子，貼春聯，四合院，吊腳樓，踢毽子等等。
日本民俗現象的例子：插秧苗，吃年糕，住草房，拜祖先，唱民謠。
以上只是幾個民俗現象，實際上，民俗涵蓋了生產生活的方方面面。説的詳細一點，它指以第一產業為主要生存手段的人，如農民，漁民等等的生活樣式，包括生產，衣食住行，婚葬嫁娶，節日慶典，娛樂活動，等等。簡單地説，民俗是傳承於民間大眾之間的生活文化。
日本民俗學最早由柳田國男(1875-1962)提出。柳田國男年輕時專攻農政學，後成為明治政府官員。為區別於着重於君王，朝代更替等等“大人物”“大事件”的歷史學，柳田國男提出了“常民”這一概念，而“常民”的歷史研究，則為民俗學的起點。近年由於日本現代化，都市化的加速，傳統意義上的“民俗”正在漸漸“死去”，所以民俗學的視點也在變化。
需要注意的是，民俗並不等同於文化。民俗是傳統的大眾文化，生活文化，庶民文化，一些國粹級別的非大眾的東西，如京劇，可稱為藝術，但我認為不能算民俗。一些非傳統的新事物，如 AV 漫畫，也不能算民俗。小説或電影，是文學，是藝術，也不能籠統的歸為民俗。民俗多指現存文化，已經消失很久的，如浮世繪，算是歷史吧。
所以如果一定要議，這個問題應該改為“日本文化為什麼給人色情和變態的印象”。
不過，關於生殖器崇拜的問題，姑且可算作民俗問題，這裏具體説一説。
民俗中的生殖器崇拜——金山祭
我猜，題主所指應該是神奈川縣金山神社每年四月一日舉辦的かなまら祭り(圖省事兒以下稱金山祭)。這個算是在國外最有名的日本生殖器崇拜祭典活動了。
貼幾張圖片
金山祭當日盛況 (來源：かなまら祭り)
金山神社外貌(來源：http://Wiki.JP - 金山神社 (川崎市) )
話説金山祭所在的金山神社，原址位於神奈川的川崎宿。川崎宿是江户時代的驛站，而驛站中的旅店等多“飯盛女(中文：盛飯女)”，即私娼。
關於盛飯女，柳田國男曾在《石神問答》中提到過。(《石神問答》原文在此：近代デジタルライブラリー)這裏再解釋一下《石神問答》。《石神問答》是柳田國男與另一位學者山中共古的書信討論，內容龐雜，後被人整理成書。主要內容為日本各地所見的“石神信仰”。柳田國男注意到石神信仰的神體多為男女性器的石器，所求內容多為安產。而石神多發音為「じゃく」或「しゃく」等，寫成漢字為“杓子”，即盛飯的勺子。柳田在書中推測盛飯女之所以叫盛飯女，和石神信仰有關。
於是，金山神社在江户時代就成了這些“盛飯女”們求除性病，求“買賣”興隆的地方，金山祭由此發足。那麼這個金山大神的神體(注意，是殿內的神體，不是外頭扛着走動的男性性器形狀的東西，那個是神轎)是誰呢?其原是神話傳説中的火神，早先為礦山和冶煉之神，由於冶煉的時候拉風箱的動作讓人聯想到性交，所以金山大神便也有了安產授子的職責。
金山神社殿內神體(來源：http://Wiki.JP - 金山神社 (川崎市) )
明治後期鐵道開始發展，驛站衰退，金山祭同川崎宿的私娼生意一同衰落了。昭和 40 年(1965 年)，作為性信仰仍然殘留的神社，金山神社被國外的民俗學者關注。又於 1977 年，當地人小規模的重新把金山祭搞了起來。一開始是外國人的觀光項目，昭和 60 年又和祛除艾滋病聯繫起來，觀光客越來越多，現在主要是祈求買賣興隆，子孫繁榮，安產，求姻緣，夫婦恩愛。
金山祭當日的外國人 (來源：かなまら祭り)
金山祭的發展歷史，實際上分兩個階段。
第一階段是江户到明治時代這段時期，其興盛伴隨着驛站私娼行業的興盛，是傳統風俗行業鏈條下的出現的信仰活動。此時的金山祭是地方性的，小規模的，特定職業羣體的特定信仰活動。
第二階段是昭和 40 年至今的這段時間。此階段的金山祭是由於外國人的來訪致使當地人的自我文化意識形成，在這種意識下產生的地方復興和旅遊觀光開發活動。這個階段的金山祭是“被”代表了日本的，被世界所知的，信仰性減弱娛樂色彩增強的活動。
而題主所知的“色情變態”的活動，恰恰是第二階段的金山祭。然而諷刺的是，後者的出現，可以説是外國民俗學者和觀光客造成的。外國民俗學者的矚目導致當地人意識到這是“重要的傳統”，進而將其復興。那麼到底是日本人猥瑣，還是外國人猥瑣?這個問題還真不好説。
所以當談起日本民俗中的性，如金山祭的例子，其實是非常有特定性的。它之所以能夠於近代依然存留下來，有其特定的發生背景——驛站風俗產業。不能將其看做全日本的普遍的民俗現象。
日本的現代情色產業
現代日本的色情產業很豐富。比如：
1. 文學，電影，AV，遊戲，動漫等文學藝術遊戲作品中的情色
2. 提供陪酒服務，女體盛服務，性服務的各種風俗(色情服務)類店鋪
3. 提供觀看空間的光盤租賃店鋪和情人酒店(Love Hotel)
除了這些之外，還有成人用品的自動販賣機，便利店的成人雜誌角等，色情無處不在。
但是，需要注意的是，這些色情都是產業。即生產和消費的關係。這是一種自由買賣的關係，消費者付錢購買商品或服務，消費者和出售者之間誰也不認識誰，互相之間對服務內容達成一致，交易便成立。這跟強姦這種非雙方自願的行為不一樣，更和亂倫等家族或認識的人之間的性行為更不一樣。對日本人有暴力，亂倫等印象的，這是 AV 看太多，人家那是情節需要請勿模仿，非要當成是現實……只能勸您早點兒擼擼睡吧。
最後
如前文，雖不好説日本民俗乃至日本文化全體都是“色情而變態”的，但是現代日本色情產業發達，產業細化，花樣繁多，也是事實。日本的法律允許一定程度的色情產業，這是一種管理手段，通過這些合法產業降低現實中的犯罪率。而在中國，色情行業因為政策原因很“地下”。但是政策不允許不代表人們沒需要，也不代表中國的色情產業就小，鄰國日本的 AV 大量進入中國市場，中國人不愛情色，日本情色文化怎麼能在中國傳播的這麼廣?
其實金山祭和日本 AV 是有共通之處的。日本人的金山祭，外國學者來調查，火了。日本人拍了 AV，外國人大看特看，又火了。作為消費者，吃着免費的午餐，就別得了便宜賣乖了，一邊對着屏幕擼，一邊罵日本人變態，這是有多傲嬌。
最後，此題里正經跟“民俗”有關的，也就是生殖崇拜的部分吧。更多的説的是“風俗”，多見拿風俗當民俗的國人吹噓自己的正經，沒見幾個人真正關心日本老百姓的生活。