説到藏南不得不説的一個事情,當年英國侵略印度到達西藏的邊界。一名英國外交官亨利·麥克馬洪，因為他主持了1914年討論此邊界的西姆拉會議。其走向起自不丹和西藏交界處，大致沿分水嶺和山脊線至雲南獨龍江東南的伊素拉希山口，將傳統上被認為屬於西藏的約9萬平方公里領土非法劃給印度和緬甸。這就是臭名昭著的麥克馬洪線。
麥克馬洪線並不是一條畫在分水嶺上的邊界線，全線有7處被河流穿越，給中國與印度、中國與緬甸的關係留下後患，由於各自國家對麥克馬洪線的不同理解，造成了衝突，例如中緬之間產生獨龍江歸屬之爭，中印之間產生克節朗河流域歸屬之爭，以及中印緬三國交界是位於底福山口，還是塔廬山口之爭。但中國曆屆政府都不承認其國際法效力。
我國政府一直拒絕承認麥克馬洪線，自古以來藏南屬於西藏是中國不可分割的一部分要求印度巡邏隊不可越過，為了緩解邊境衝突我國巡邏隊也不越過。中印兩國自1962年戰後的一系列爭端，都是印度對邊境挑釁有關，因為印度越過邊界我方自衞反擊。結果由於這條邊界引致1962年的中印邊界戰爭，中國決心出兵教訓一下印度，印度雖得到美國及蘇聯的支持，仍然戰敗。中國雖然在戰爭中勝出，我國也平着邊境友好不希望戰爭，表示可以同印度開展互惠互利邊界談判，山峯的連線作為勘界標準。但由於印度認定麥克馬洪線就是申索藏南地區的合法依據，因此再度非法佔領藏南。使印度得以繼續控制麥克馬洪線以南的地區。
1987年印度國會通過法令，非法將麥克馬洪線以南的中印爭議地區（我國的藏南）和印緬邊界一些地區合併建立阿魯納恰爾邦，中印爭議地區的面積佔該邦總面積的80％。目前，印度已有30萬的移民屯居在這個爭議的邊境上。中國以後如果再提出邊界問題，如何處理這些移民將有頗大困難。
麥克馬洪線經過許多高寒、偏僻地帶，這些地方還都沒有駐軍，但還是派遣巡邏隊定期交替巡邏。在一些巡邏到的過渡地帶，我方軍隊都會留下標記以宣示主權。但由修路或軍隊巡邏而引起的邊境對峙和衝突也時有發生。