清朝時期，蒙古地區大致分為三塊，分別為：最早納入清朝統治區域內的漠南蒙古，與如今外蒙古大致類似的漠北喀爾喀蒙古，和衞拉特四部所在的漠西蒙古。
漠南蒙古就是如今內蒙古大部分地區，自然，漠南蒙古也是蒙古各地中人數最多、水草最豐美、資源最豐富的地區。同時，漠南蒙古也是清朝最早征服的蒙古地區。
綠色部分為漠西和漠北蒙古
早在清軍尚未入關之前，尚是一個東北地區政權的後金，就徹底擊敗了蒙古末代大汗林丹汗，佔據了整個漠南地區。從此之後，清朝不但徹底清除了西部最大的威脅，吞併漠南蒙古之後，實力也有了急劇的增長。
清軍敢在公元1644年傾巢而出大舉入關，並最終佔領天下，也與征服漠南蒙古有莫大的關係。因為，入關的清軍不但有大量蒙古騎兵，同時，征服漠南蒙古，沒有了後顧之憂，清廷才敢抽調大部主力南下。
漠北蒙古就是我們通常所説的外蒙古，漠北蒙古由於緯度更為靠北，且直接與寒冷的西伯利亞地區接壤，因此，哪怕對於蒙古諸部而言，這也屬於環境嚴酷地區。當時的漠北蒙古被喀爾喀三部佔據。
清初漠北、漠西蒙古形勢圖
雖然在皇太極時期，喀爾喀三部曾向皇太極進九白之貢，名義上臣服了清朝，但實際上，當時的漠北三部依然各行其是，並未真正成為清朝藩屬。
不過，這一情況在清朝康熙年間發生變化，崛起於西域的衞拉特蒙古在首領噶爾丹的率領下，建立了強盛一時時的準噶爾汗國，為了實現其統一蒙古的野心，噶爾丹毫不猶豫地對近在咫尺的漠北蒙古發動的進攻，憑藉強橫的武力，噶爾丹將喀爾喀三部打得落花流水。
在這種情況下，為了保住富貴，喀爾喀蒙古貴族們被迫向清朝求助，康熙皇帝趁機恩威並用，通過軍事、貿易等諸多手段，最終迫使喀爾喀三部屈服。公元1691年，即清康熙30年，多倫諾爾會盟之後，喀爾喀三部正式成為了清朝的蕃部，外蒙古從此成為中國的一部分。
康熙年間外蒙
既然直到康熙年間才徹底臣服，外蒙古也一直有與中央離心的傾向，那麼，許多人因此產生這樣的疑問：清朝為什麼不對外蒙古進行分拆，以徹底消除其分離的可能呢？
其實，這個説法並不準確，清朝對於蒙古等地的統治的政策總體上是十分成功的。對於包括外蒙古在內的諸多遊牧部落，清廷的行政管理方式是：“眾建以分其勢”。
什麼意思呢？就是清廷在漠北蒙古對於各部多設扎薩克，而各部扎薩克，卻互不同屬，從而將其徹底分化，使漠北無法形成統一強大的勢力，以抗衡清廷中央。扎薩克，就是清廷對於蒙古等地設置的基本統治單位。
外蒙古
在漠北蒙古，僅在乾隆年間，喀爾喀部扎薩克就高達86個。而在雍正繼位的第3年，雍正皇帝又從喀爾喀三部之中的部分出了21旗，設立了塞因諾顏部，使得喀爾喀分為了4部。與此同時，清廷在喀爾喀四部中又設立了正副盟長，進一步“分其勢”。
可以説，清廷對於漠北蒙古的政策是十分有效的，整個清朝期間，喀爾喀蒙古雖然並非完全安穩無事，也曾發生過撤驛之變等兵變，但總體而言，並未形成大的亂子，更沒有如清朝之前諸多中原王朝一樣，讓漠北蒙古成為中原王朝的心腹大患。
那麼，為什麼外蒙古最終又分裂出中國呢？這個原因也十分複雜，一方面，與清朝對於蒙古的政策有直接關係，雖然清朝對蒙古的“眾建以分其勢”的政策行之有效，但與此同時，清廷對於漢蒙分離的嚴格分離，也使得在清朝數百年間的統治期間，蒙古地區不但沒有徹底的融入中國，反而與漢地漸行漸遠。
如今的蒙古國
可以説，在清朝統治的數百年間，外蒙古地區雖然是中國的一部分，但是無論是語言、文字，還是生活方式，都與中原地區大相徑庭。這樣的情況，在王朝鼎盛時期自然不會有多大問題，但是，一旦王朝衰落，這些地區勢必會升起分離之心。
而在清朝末年，情況還遠比其他王朝末期更為複雜，清朝末年，除了清王朝內部的一系列問題，在外部，也開始面臨歐洲列強的堅船利炮。而外蒙古的最終分裂，也與列強有直接的關係。
從康熙年間漠北蒙古徹底臣服清朝開始，沙俄的勢力就開始觸及到了外蒙古地區。清朝中期，喀爾喀蒙古的多次動亂，背後都有沙俄的黑手。而到了清王朝急劇沒落的晚期，沙俄更是明目張膽地將侵略的觸角深入了漠北蒙古地區。
沙俄的黃俄羅斯計劃
最終，在清朝滅亡民國建立，中央政府對於蒙古地區統治急劇衰弱之時，在沙俄的支持下，外蒙古開始事實上分離出中國。1945年，二戰結束之際，在沙俄的繼任者蘇聯的支持之下，外蒙古徹底分離出中國。
因此，在清末民初內蒙古分離出中國，其實與中央王朝的控制力有直接的關係，無論清朝有沒有將外蒙古地區拆分，一旦中央王朝衰落，一旦中央王朝對於外蒙古地區的控制力急劇減退，在別有用心的人的挑動之下，在列強的支持之下，外蒙古地區都將面臨分離出中國的危險。