公元1626年，努爾哈赤病重，他前往清河湯泉利用温泉減輕病痛，並向天神祈求健康，但他的病情並沒有好轉，反而更加惡化，最後在這一年的8月病逝。
對於努爾哈赤的死因，清朝史官並未記錄，史書上對此事諱莫如深，沒有提及努爾哈赤得了什麼病。
不過，明朝大將袁崇煥在收到努爾哈赤死訊後，立刻嚮明朝報捷，並言明努爾哈赤在寧遠大敗之後，得了“癰疽”，最後不治而亡。
這裏提到的寧遠之戰，也就是在公元1626年正月23日，努爾哈赤率領軍隊進攻寧遠的戰役，當時努爾哈赤的軍隊剛剛抵達寧遠城，就遭到了明軍的炮擊，死傷了數十人，因此努爾哈赤只能將營地遷往明軍大炮射程之外的地方。
在24日，努爾哈赤派兵攻打寧遠城的西南角，明軍向城下投擲火球，後金軍隊攻城受挫，後來換了一個方向進攻，結果依然沒有進展。這場戰鬥從清晨打到了晚上，後金軍隊損失慘重，城下的屍體堆積如山，努爾哈赤只好下令退兵。
在25日，後金軍隊繼續猛攻寧遠城，死傷了很多士兵，但還是沒有進展。
在26日，努爾哈赤放棄進攻寧遠城，並派兵進攻“菊花島”上的明軍糧倉，此時海水已經結冰，後金騎兵從海上踏冰而行，最後島上的7000明軍全軍覆沒，努爾哈赤帶着這批物資返回了瀋陽。
在袁崇煥遞交奏摺之後，東江守將毛文龍也向朝廷遞交了一份奏摺，他在奏摺中詳細記錄了努爾哈赤得病的經過，以及最後的死因。當時他在後金安插了一個奸細，此人前往後金都城瀋陽打探情報，最後發現努爾哈赤得了“癰疽”，於是立刻向毛文龍彙報了情況，並請求他立刻發兵一萬攻打瀋陽，定能成就大功！
可惜因為一些特殊原因，毛文龍並未發兵，而是又派出150多人打探情報，這些人回來都説“老奴背果患瘡，帶兵下營狗兒嶺湯泉洗瘡。”
最後，毛文龍還是沒有派兵，而是再次派人打探情報，得到了努爾哈赤病逝的消息。
東江也就是現在的朝鮮皮島，位於後金的大後方，毛文龍在此處建立根據地，隨時準備進攻後金，這也導致後金不敢肆無忌憚的進攻明朝。不僅如此，皮島距離後金更近，毛文龍可以更加方便的獲取情報，而且也更加準確，因此可以確定努爾哈赤的死因就是“癰疽”。
“癰疽”也就是後背上長了一個“毒瘡”，毒性很大，而且容易擴散，一旦毒發就會危及生命，在當時無法進行外科手術的情況下，只能通過温泉水消毒殺菌，但效果並不明顯。努爾哈赤前往清河湯泉治病，這也説明他確實得了“癰疽”
現在有些史學家認為努爾哈赤在寧遠之戰中受了重傷，最後不治而亡，但袁崇煥並未在奏摺中提及這件事。他是這場戰役的指揮官，曾親自站在城牆上指揮戰鬥，如果他發現努爾哈赤被明軍大炮擊中，不管是將努爾哈赤擊傷，還是將其擊斃，他肯定會上報朝廷。
畢竟他為明朝除去了心頭之患，這樣的功勞不亞於開國之功，但袁崇煥並沒有誇大其實，這也就説明了努爾哈赤在這場戰鬥中並沒有受傷。
我們可以分析一下當時的情況，此時的努爾哈赤已經68歲了，常年征戰在外，他的身體已經不行了，在寧遠之戰失敗後，努爾哈赤心情倍感失落，因此得了“癰疽”，最後結束了他的一生，或許這才是最合理的解釋！