所謂重點大學即重點建設高校，有全國重點高校和省屬重點高校之別，一般而言，我認為泛指中央部屬和省屬的“211工程”重點建設高校（全國116所）。
所謂一本院校和二本院校是根據高招錄取先後順序劃分的，重點高校都在本科一批次招錄，也就是説重點大學一定是一本院校，而並不是所有的一本院校都是重點大學。
三者主要區別：
一是錄取分數不同。重點大學在各省錄取分數線一般遠遠高於其他一本院校，一本院校錄取分數線遠遠高於二本院校錄取分數，比如2018年吉林省理科一本線533分，二本線405分，三本線283分。
二是專業學費不同。一般而言，二本院校（特別是民辦、獨立學院）院校的專業學費較高，是公辦院校的3～4倍，重點大學大都由國家財政支持，學費相對較低。
三是師資力量不同。重點大學匯聚了全國一流的師資力量，名師大咖雲集，兩院院士眾多，遠遠好於其他一本院校，二本院校更是相差甚遠。
重點大學和一些比較好的一本大學都是很早建起來的，經歷過戰火，經歷過革命，它們本身就是歷史的見證，有着深厚的歷史底藴。而且這些大學往往名師薈萃。魯迅曾在北大任教，季羨林曾在北大任教，朱自清曾在清華任教，錢玄同曾在北京師範大學任教，這樣的歷史底藴和師資力量是小學校沒法比的。
優秀的教師會吸引優秀的學生，優秀人才彙集的地方會不斷吸引更優秀的人才。人才匯聚的地方，那裏的環境、那裏的獨有氛圍帶給學生的開闊的眼界和進步的思想、那裏能給學生提供的平台和機會都比二本學校更好、更廣闊。
重點大學和好的一本大學的優點，二本比之它們自然是差了很多，但也有其存在的意義。二本學校也在努力為學生提供更好的環境，努力提高自己的教學品質，但是它們建得晚，而且也沒有國家重點扶持，所以肯定很多地方比不上重點和一本。這也就是比上不足比下有餘。
不過二本學校有一個最大的槽點就是真的很形式主義。修的新樓可能就是應付檢查從來沒見用過，宿舍衞生比作業都查得嚴，學生像是去學後勤專業的。