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哲赫忍耶創始人馬明心是回族人，他出生在甘肅隴南市，1781年農曆3月27日在蘭州城頭被清廷人殺害，去世時63歲。
馬明心教徒
馬明心，字復性，早年喪父，跟着叔父一起生活，在6歲時進入清真寺學習阿拉伯文，9歲時跟叔父於1728年沿着青海、新疆、中亞絲綢古道徒步前去麥加朝覲，途中突然遭遇風暴，導致叔侄失散，經過幾次輾轉，馬明心最後流落在中亞布哈拉，居住在“伊斯哈格”道堂做事，在導師阿卜杜勤.哈里格.阿齊茲.米斯加吉的教育下，學習蘇菲教義，履行道乘功修煉數年。在其期間先後去麥加朝覲11次，向一些著名學者請教，受益頗深。
1744年馬明心經過中亞、新疆返回河洲，途徑經過青海循化時，被當地宗教人士挽留講授《古蘭經》，之後馬明心就在河湟地區開始傳授哲赫忍耶學理，並接收門徒，講經宣教。馬明心吸收了嘎底林耶的修道，使修煉更為嚴密，在宗教禮儀方面，馬明心主張簡化宗教禮儀，宗教施捨要用在救濟窮人身上，不能用不正常手段獲得錢財，反對修建跟裝修清真寺，一切以簡化為主。
馬明心的主張得到了穆斯林的支持，信眾日益增加，威脅到華寺門宦的地位，引起了發華跟哲之間的矛盾。1762年華寺門宦第二代掌教人向政府指控馬明心，馬明心被迫離開，遷居在定西官川，來求道阿訇就有數百人，經過這些學生的多次傳播，追隨者日益增加形成了一個較大的宗教，被稱為官川門宦，而馬明心被稱為官川阿齊茲，簡稱尊貴者。
馬明心後代
馬明心後代馬元章，字光烈，號禎祥，原名馬雲鵬，是伊斯蘭教蘇菲主義哲赫林耶學派的第七任教主，經名為利牙頓丁，道號為素迪根拉.穆罕默德.努爾。公元1853年10月8日出生在雲南。
馬明心教堂
馬元章是馬明心的第四代人，馬明心的長子馬順清是馬元章的祖父。馬順清有五子，其中第三子馬聖麟，馬聖麟的長子馬元章，次子馬元坤（少亡），三子馬雲超，其中馬元章從小天資聰穎，《古蘭經》在18歲時就倒背如流，並且精通中國文史，使當時一些阿訇、長者驚訝，堪稱奇才。
馬元章在哲赫林耶派經歷的反清失敗遭遇中得到了深刻的教訓，馬元章儘量與官方調整好關係，以便取得立足之地。庚子年間，董福祥得罪了洋人，避居固原時，目睹了哲赫林耶派的興起，感到不快，計劃如何挑起事端，馬元章一方面勸教民不要跟政府作對，另一方面直言董福祥不要輕舉妄動，馬元章向政府擔保回族人民沒事，從而改變了局面，穩定了人心。
在第一次世界大戰時，土耳其參加了同盟國。而馬元章以教主的身份致電袁世凱，雖然他與土耳其同信伊斯蘭教，但是他會誠摯擁護中國政府的對外立場。馬元章的行為讓哲赫林耶派跟官方的關係得到了很大的改善。
經過20年的苦心經營，恢復、鞏固與發展哲赫林耶派，使哲赫林耶派成為繼馬明心跟馬化龍的第三次盛世時期。
馬明心積累了很多的財富，擁有道堂7處。強調道堂財產屬於宗教財產，只能使用在宗教事業上，任何人不準作為自己的私有財產揮霍。
1920年農曆十一月初七日，在甘肅海源發生了大地震，馬元章在西吉遇難不幸去世。
馬明心殉教
馬明心的死是歷代哲赫派回族人民起事的重要原因。對於馬明心的死在民間有着不同的説法，有的人認為馬明心殉教，有的人認為馬明心受到了天譴。
馬明心畫像
直到後世的歷代回族人民起事幾乎都等於哲派起事。當時馬明心的死引起了蘇四十三擴大暴動、持續數月被清廷官兵鎮壓，死亡人數達到一萬多。新仇舊恨再次激發了乾隆四十九年哲派田五暴動跟清廷的鎮壓，後來這些廣泛的仇恨又激發了清代同治時期哲合忍耶派第五代教主馬化龍起事，這次的起事持續12年或者説是16年，死亡人數達到二千萬，這是人類史上的最大悲劇。
關於馬明心殉教的説法：1781年，馬明心的弟子蘇四十三跟華寺門宦在循化因為傳教而發生矛盾，由於清廷官員偏袒華寺，所以蘇四十三率先反清，殺死了來鎮壓哲赫林耶派的知府楊璣跟副將新柱，在攻擊河洲城，圍攻蘭州時，馬明心卻被捕在蘭州城殺死，並且連累到家人，使長子馬順清被髮配到雲南墨江縣的朗寨充軍，後來被馬明心的弟子拯救。馬明心的妻子張氏跟3個女兒被髮配到伊犁為奴，長女跳河自殺，二女兒跟三女兒流落他鄉，張氏在某個旗官為奴婢，趁着過年的時候殺死旗官全家，自首被處死。馬明心全家人耕田自食，傳授道教35年，教徒遍佈整個西北，門下的弟子散居各地。由於清廷的多次鎮壓，所以馬明心的繼承人都保持着殉教者的精神，繼承跟發展哲赫林耶的宗教教旨延續至今。