1968年,“阿波羅8號”預備正駕駛。 1969年7月16日,阿姆斯壯成為“阿波羅11號”指揮官。他與年輕的宇航員邁克爾·柯林斯(1930-)和巴茲·艾德林(1930-)一起進行登月月球飛行。到達月球后,柯林斯停留在軌道上,阿姆斯壯乘小鷹號月球着陸器登上月球表面,避開月球冰礫,在寧靜海平穩着陸。阿姆斯特朗和艾德林在月球表面進行了2小時30分鐘的活動,進行科學實驗,採集岩石和土壤樣品,留下進行實驗的科學設備與紀念其着陸的徽章。他們於7月21日離開月球,7月24日返回地球。
1970年,他被南加利福尼亞大學授予航空工程碩士學位,出版《首次登上月球》一書。7月出任太空總署航空學協會副會長。1971年,在俄亥俄州的辛辛那提大學工作,任航空工程學教授。 1979年,離開辛辛那提大學。1985年,在國家太空委員會工作。