中醫學認為人體的陰陽平衡、臟腑調和，是健康的標準。而人體生命活動的基本特徵是氣機的運動，而氣機運動的基本形式是升降出入，故升降出入是氣機調暢的基礎，也是維持人體健康的必要條件。故《黃帝內經》説：“出入廢則神機化滅，升降息則氣立孤危”。人體的生理活動，包括人體之氣與天地自然之氣的交通，臟腑之間的生剋制化，精微物質的流佈代謝，正氣對病邪的抵禦驅逐等，都依賴氣機的升降出入。外界病邪侵入人體以後，人體氣機首先要受到影響。人體氣機的升降出入雖然是諸多臟腑功能的反映，也是由諸多臟腑功能所維持的，但其中肝膽和脾胃的功能尤其重要。
這是因為肝膽是人體氣機出入的樞紐，而脾胃是人體氣機升降的樞紐。脾胃同居中焦，以膜相連，脾主升，胃主降。膽主少陽春升之氣，膽氣運行的特點是“發陳”，陽氣初生，由裏向外；肝為厥陰，陰氣初生，由外向裏。膽氣出，肝氣入，故二者為人體氣機出入的樞紐。肝膽脾胃四個器官的氣機升降出入正常，則一身之氣得以調暢；如果其氣機升降出入失常，則一身之氣皆有可能受到影響。反過來，肝膽脾胃的樞紐作用也常常受到其它臟腑病變的影響。醫者在治療疾病時，要注意順從其性，促進和恢復它們的升降出入。
善治病者重視調氣，善調氣者重視調暢肝膽和脾胃之氣。在《傷寒論》中，張仲景用柴胡劑調暢肝膽，用瀉心劑調理脾胃，此最堪為後世效法。《神農本草經》關於柴胡的論述説：“氣味苦、平，無毒。主心腹腸胃中結氣，飲食積聚，寒熱邪氣，推陳致新。久服輕身、明目、益精”。説明柴胡可促進六腑的新陳代謝，能推動少陽樞機，推動氣機出入，並由此起到調和表裏，消積化食，促進臟腑功能的正常運行。在《傷寒雜病論》中的柴胡類方劑中，小柴胡湯是張仲景調理肝膽氣機的代表方劑，其方是由柴胡半斤，黃芩三兩，人蔘三兩，半夏半升，灸甘草三兩，生薑三兩，大棗十二枚組成，方中柴胡辛散以助少陽膽氣外出，黃芩苦寒以助厥陰肝氣入內，柴胡，黃芩並用，則出入如常。半夏豁痰飲，降裏氣之逆；姜，棗，人蔘和脾胃而壯裏氣，使裏不受邪而和。然而對於柴胡和黃芩的使用，關鍵在於柴胡的疏解，故《傷寒雜病論》中運轉樞機時，黃芩或可減去，而柴胡卻是必用藥物。
按照張仲景的手法，柴胡劑中還可以利用芍藥的酸收功能，用柴胡和芍芍藥相配伍，這樣一出一入，一散一收，促進肝膽之氣的出入。《傷寒雜病論》中最具代表性的方劑就是四逆散，此方證是三陽傳厥陰的合病，屬少陽厥陰合病，故此方劑是治療陽邪熱厥的。只有四味藥組成，分別為灸甘草，枳實，柴胡，芍藥。其用量都是一樣。在此方中柴胡辛散以疏肝之陽出，芍藥酸收以瀉肝之陰而入；甘草以緩肝之氣，枳實以破肝之逆，故此方可外走少陽之陽，內走厥陰之陰，故肝膽疏泄如常，而厥可通。
調理脾胃升降主要就是要降胃升脾。胃氣以降為順，胃氣不降每由火旺氣實所致，故降胃多用黃連、黃芩以清熱，清火即是降胃。三黃瀉心湯治療吐衄，乾薑黃芩黃連人蔘湯治療寒格吐逆，皆屬清火降胃。張仲景也習慣使用生薑，半夏降逆和胃，此大抵為痰飲所致者而設。脾氣以升為常，脾氣不升多兼裏寒，故既用參、草來益氣，也用乾薑來温中。脾胃升降之間存在相互促進、相互依賴、相互影響的關係。用仲景的方法治理脾胃，不治氣而氣機自調，脾胃升降自然恢復正常。後世在使用半夏瀉心劑時，因為半夏瀉心湯證為中陽受傷，少陽邪熱乘虛內陷所致，心下痞即是胃脘，屬脾胃病變兼少陽裏不成實者，故也有加枳實、木香、砂仁的方法，直接使用理氣之藥調理脾胃，也有一定的道理。
總之，運轉樞機、疏利肝膽、調理脾胃是治療疾病的重要途徑，無論何種疾病，無論病情多麼複雜，寒熱夾雜，虛實疑似，表裏不和，上下不通，雖然看起來治療很難，但只要表現出胸脅苦滿，口苦納差，其脈弦細，即可用柴胡劑調暢肝膽，樞機一轉，病可自愈。只要表現出脘腹痞悶，胃不降而嘔逆，脾不升而溏瀉，即可用瀉心劑調理脾胃，脾胃升降恢復正常，其病也可自然向愈。