孔融是孔子二十世孫，四歲讓梨成為二千年來幼兒教科案例，公元196年孔融兵敗北海後被漢獻帝任命為少府，其言論激烈，愛評政事，曹操對其恨之入骨，但因其孔門之後，儒學士族的領袖，對其毫無辦法。
公元208年，曹軍北征烏桓得勝回許都，正逢孔融發表了《父母無恩論》，曹操抓住機會，在南征荊州之前處死了孔融。
曹操殺孔融絕非意氣用事，而是深謀遠慮的決定。曹操的政治抱負是推行寒門法家，他是想利用漢末亂世的機會，打破漢朝長期以來漸漸形成的名門世家掌控潮流，同時也要打破漢武帝獨尊儒術所形成的儒家獨尊局面，重建法家的治國思想。
所以曹操之前殺邊讓不過是試探，穩定北方後，殺孔二十世孫才是真正地對儒家宣戰，以至於後來殺楊修，也是對其父楊彪的打擊。
挾天子以令諸侯不過是曹操為了實現政治抱負的手段，事實上，“衣帶詔事件”的主角車騎將軍董承、偏將軍王服等等，包括袁紹、劉備、馬騰，他們僅僅是曹操政治上的敵人。
孔融、邊讓、禰衡、楊彪等等儒家名士，其實並不反對挾天以令諸侯，如果是袁紹挾天以令諸侯，他們説不定還會全力支持。他們反對的是曹操寒門法家思想，他們要維護儒家士族的正統地位，不遺餘力地破壞曹操掌權的合法性，他們則是曹操思想上的敵人。
這也是司馬懿一直不想加入曹操陣營的根本原因。至於荀彧，沒有受到孔融事件的影響，只因為他是保皇派，與孔融等人不同。當然，處死孔融對赤壁之戰還是有一定的影響，儒學士族在後方下黑手，分散了曹操的注意力。