太后對於甄嬛的不喜，其實十分明顯。畢竟太后一心想要維護烏拉那拉氏的後位，皇上對於純元的感情，太后自然十分清楚，所以當太后見到甄嬛那一刻她就知道，甄嬛一定會威脅到宜修的後位。
甄嬛入宮後，皇上幾乎都忘記了選秀當日那個讓他驚鴻一瞥的甄嬛，太后也逐漸遺忘了這個長得酷似純元的秀女。
當甄嬛獲得皇上的盛寵時，太后心中也對甄嬛心生不滿，但是又無能為力。一來是太后認為，皇上之所以喜愛甄嬛，是因為她長得很像已故的純元皇后。這樣一來，若是甄嬛有什麼歪心思，那就必然會威脅到宜修的皇后之位。
二來是太后不方便插手後宮之事，加之甄嬛入宮良久，似乎也並未做出任何出格的事情。
甄嬛失寵決定出宮修行，對於一心想保住烏拉那拉氏族後位的太后而言，可以説是鬆了一口大氣。畢竟華妃倒台、甄嬛失寵之後，後宮之中就再也沒有妃嬪能夠威脅到宜修皇后了。
但太后卻沒有因此默許宜修剷除甄嬛這個心頭大患，甚至還特地囑咐自己身邊的竹息姑姑，定時到甘露寺尋甄嬛討要佛經。
眾所周知，太后討要佛經是假，想要保住甄嬛的性命才是真。
宜修不是沒有想過徹底瞭解甄嬛的性命，好杜絕後顧之憂。但是太后讓竹息定時前往甘露寺這個舉動，無疑就是在警告宜修，不要對甄嬛輕舉妄動。
甄嬛前往甘露寺，就已經是眾人眼中無法復寵的廢妃了，加之太后一向不喜甄嬛，為何還是想要將甄嬛從宜修的毒手之中拯救出來？
皇上是太后的親生子，其實皇上對甄嬛的感情，太后都看在眼裏。只不過一開始的太后和宜修一樣認為，皇上寵愛甄嬛，無非就是因為甄嬛酷似已故的純元皇后。
甄嬛出宮之後，皇上對甄嬛的思念從未停止。雖然皇上嘴上不説，但太后都心知肚明，皇上對甄嬛的感情，絕不僅僅是因為甄嬛那張酷似純元的臉。
後宮眾多妃嬪，太后最喜愛的一定就是沈眉莊。在原著之中沈眉莊和太后的感情，比影視劇當中呈現得更為深厚，太后對沈眉莊的感情甚至超越了對皇上的感情。
沈眉莊和甄嬛情同姐妹，所以甄嬛在甘露寺的艱苦，沈眉莊不可能不知道，也不可能不心疼。而太后也不捨眉莊日夜向她替甄嬛求情，於是便隨了眉莊的願罷。
但實際上無論是皇上的思念亦或是眉莊的求情，都敵不過太后自己想要救甄嬛的心。
宜修這些年的所作所為，太后都看在眼裏，所以當年純元的死，太后肯定也知道有所蹊蹺。但是她無能為力，太后曾經恍惚間認為，甄嬛是純元的轉世。她無法挽救死於宜修毒手下的純元，但是她希望能夠拯救甄嬛。
其實甄嬛若是出自烏雅氏族或是烏拉那拉氏族，太后一定會十分喜愛甄嬛。甄嬛復寵回宮後整治後宮的一系列手段獲得了太后的肯定，太后心裏也清楚，比起華妃的跋扈囂張以及宜修的心狠手辣，甄嬛才是最適合替皇上打理六宮之事的人。
只不過太后心中對於甄嬛長得像純元這一點，始終有一些異樣的感覺。