據日本廣播協會（HNK）9日報道，昨天下午在奈良因襲擊死亡的日本前首相安倍晉三已經完成遺體解剖檢查工作，目前已經被護送從奈良縣立醫科大學附屬醫院出發，送往安倍位於東京的家。這家醫院宣佈安倍的準確死亡時間是在當地時間8日下午17點03分，距離他受傷過去了5個半小時左右；當時由於檢驗程序尚未開始，日方對外公佈的死因是“傷重搶救無效”。
報道提到，在安倍遇襲一個多小時後，當地媒體就曝光了很多傷情細節。其中包括他在受傷倒地後尚有意識，但抬上救護車不久就失去生命體徵，心肺功能也已經停止。日媒稱安倍被霰彈槍（警方後續更正為手槍）“擊中胸口”，心臟似乎受創；後續日本京都府立醫科大學教授太田凡（未參與搶救）和另一名日本醫科大學急救中心主任在聲明中也沿用了“心臟受傷”的説法，並建議開胸清理血塊和進行手術止血。英媒、美媒和歐洲電視台在新聞中均提到了安倍左胸口受擊的證詞，並默認這是襲擊的致命原因。
但日本奈良縣警方9日公佈的最新解剖結論中，推翻了外界盛傳安倍“心臟受損”死亡的説法。警方根據司法解剖確定，安倍的具體死因是左上臂部被射中，致鎖骨下動脈損傷，進而引發失血過多死亡，和心臟沒有關係。另外嫌犯槍擊命中的兩個部位分別是左上臂部（即致死原因部位）和頭頸部，準確説也不是“左胸”。有相關醫學人士解釋稱，鎖骨下動脈破裂出血如果得不到止血的話，短則在十分鐘內就會引發休克以及死亡，醫院也稱他們開始搶救時安倍已經處於心肺停止狀態。
值得注意的是，警方還公佈安倍身上出現了“第三個創傷”，這個傷口在頭頸部位，司法鑑定結論稱其“無法判斷是否由槍彈所致”。從日媒目前公佈的視頻中可以看到，嫌犯山上徹也從人羣中衝出對安倍的後背開了兩槍，第一槍似乎沒有命中（安倍有回頭看的動作），第二槍擊發後不久安倍就倒地了，所以有人認為他只有第二槍是打中的。還有警方修改“霰彈槍”為手槍的原因也沒有説明，外界推測襲擊者用的可能不是多彈頭的武器而是獨彈頭的槍械。
但無論如何，嫌犯所持槍支是“雙管”的，在身上造成三處創傷顯得非常不正常。有陰謀論支持者認為安倍之死“有外界原因參與”，他們懷疑的原因還有現場非常專業的保鏢在事發時候發生了“集體遲鈍”，在第一槍後沒有撲倒安倍或者採取緊急防衞手段，但這些説法都沒有任何可靠證據支撐，嫌犯目前已經認罪並表示是其單獨行為。也有一些評論對警方公佈的“模糊、莫名其妙的解剖報告”表示憤怒，認為如此重要的事情居然遺留了一個“無法確定的傷口”匆忙結案，這種態度真的是極其敷衍。