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公務員和事業編制雖然同屬於正式幹部，但是兩者之間也存在很多差距，不能相提並論。在事業編制工作人員的眼中，主要是這3個方面的不同，造成了自己與公務員之間最大的差距。
第一，晉升渠道比公務員窄
為什麼説事業編制工作人員的晉升渠道要比公務員的窄呢，首先是因為事業編制的種類不同，事業編制分為專業技術人員，工勤人員和管理人員，這3類人員除了管理人員外，其他2類人員都可以通過評職稱或者考職稱達到晉升的目的。但無論是評還是考，相比而言對學歷、工作年限、技能掌握情況的要求，都要比公務員晉升職級難的多，而且數量也會少的多。
而對於事業單位管理人員的晉升則相對難度更大。在機關事業單位中，管理人員在工作使用方面其實是參照公務員來執行的，基本上與公務員沒有太大差異，但是他們本身不具有參公身份，因此在晉升職級方面卻依舊是按照事業單位的標準執行的。管理人員的晉升都是由組織部門決定的，晉升途徑與提拔幹部的標準一樣，這也導致了很多管理人員晉升難，甚至在9級這個職員崗位上一直幹到退休。
第二，提拔崗位比公務員低
即便是副科級幹部這個層面的提拔，對於不同編制的幹部來説，也不是所有的崗位都是一樣的。所提拔的崗位不同，也決定了下一步的交流任職方向不同。一般情況下，事業編制工作人員的提拔崗位都比公務員的提拔崗位低一個層級，只有在這個層級上工作一段時間後，才可以通過平級轉任到重要崗位的方式，調動到其他崗位，當然這其中還涉及到一個轉身份的問題。
對於事業編制工作人員來説，提拔副科級的崗位大多為二級事業單位。舉個例子説明，比如同在鄉鎮辦公室工作的2名文秘人員，一名為公務員，一名為事業編制，同時提拔為副科級領導幹部，具有公務員身份的人可以提拔為副鎮長，具有事業編編制的人則提拔為鄉鎮所屬公共事業中心的負責人。看起來似乎都是副科，但是下一步交流時卻不同，副鎮長可以提拔為副書記，但是鄉鎮公共事業中心的負責人，要麼換一箇中心繼續任職，要麼只有通過鄉鎮人代會轉身份後才可以當副鎮長，後面這種操作是很多事業人員都盼望的。這就是編制不同造成的不同。
第三，所得收入比公務員少
公務員的工資由4個部分構成，包括基本工資、工齡工資、獎勵工資、補助工資，由於公務員的職級晉升較快，所以工資的提標方面更佔優勢。事業編制的工資重要的由2個部分構成，主要是崗位工資和薪級工資，薪級工資每級之間的差距不是很大，但是崗位工資之間的差距較大，職務晉升只主要影響的就是崗位工資的高低，晉升難也就説明了崗位工資相對較低。
公務員和事業編制工資之間的差距，一方面是因為職務晉升造成的，這對於基層的管理崗幹部來説尤為明顯；另一方面是因為公車改革後的車補造成的，因為公務員車補一項收入就要500元左右。總體而言，基層事業編制的工作人員相比公務員來説收入要低一些，除非具有一定的職稱。